作者GG810424 (小G)
看板Biotech
標題[討論] 請問版上有人用過Maxquant 分析SILAC嗎？
時間Sat Sep 10 15:18:04 2016
我是利用UPLC-MS/MS 分析完的raw data ,有用SILAC heavy和 light label細胞，然後將
這個Raw data 拿去跑Maxquant ，操作是參考2016Maxquant summer school的影片學的（
YouTube)，但是分析完有許多protein的ratio 顯示沒有任何值或意義,後來發現是有全有
全無的現象，也就是說heavy 和light 其中一個signal 是得到0這個intensity ，如果不
希望算出來的值是沒有意義，就必須要有最低值的設定，把0設定成100之類的，請問版上
有人有相關經驗的嗎？有用過Maxquant 的版友可站內信一起討論，謝謝
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1F：推 tynse71864: 樓主是強者 快拜 ( 09/10 17:45
2F：推 grazzilybear: 可以利用persus分析,他有用分佈補足ratio 09/22 10:44