作者michaelhsien (MichaelHsien)
看板Biotech
標題[討論] 推薦的RNA seq廠商
時間Mon Jul 11 10:07:26 2016
哈囉大家好
我的研究想要做RNA seq
詢問了幾家廠商，發現有不少人在做
像是 基龍米克斯、源資、圖爾斯…等等（非廣告）
但是不知道這幾家廠商定序品質及事後分析服務是否完善
(我們不是很擅長生物資訊方面，所以希望事後分析要夠好...)
請問板上的各位
是否有推薦的廠商
或是很雷的廠商…QQ
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.10.22.63
※ 文章網址: https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/Biotech/M.1468202849.A.4CD.html
1F：推 jabari: 都很雷啊... 簡單作法 叫每間都報 討論你要怎麼作 07/11 13:18
2F：→ jabari: 如果你們lab本身找不到生資分析人員 我建議先找別的lab合 07/11 13:19
3F：→ jabari: 作 然後再請他們推薦要找哪間跑RNA seq 07/11 13:19
4F：推 silverberry: 淚推樓上! 07/11 16:05
5F：推 chong: 很多都是外包，收件後送到北京華大定序分析 07/11 17:23
其實我比較在意定序後的分析...
不知道jabari和silverberry有什麼辛酸血淚史嗎...?
※ 編輯: michaelhsien (61.230.145.1), 07/11/2016 20:39:28
6F：推 michealking: 值拿回來 丟IPA 07/11 21:03
7F：推 lelojack: 廠商的好處是報告弄的漂漂亮亮的 很好理解，但沒法跟你 07/11 21:14
8F：→ lelojack: 分析到最後， 學術合作可以跟你磨到後面，但報告的UI做 07/11 21:14
9F：→ lelojack: 不好 07/11 21:14
10F：推 abcam: 台灣的廠商都外送到大陸了～根本沒有在台灣做啊 07/11 21:17
11F：→ abcam: 面對中國的產品與服務，我們就要面對他囉～(老闆說的)datab 07/11 21:18
12F：→ abcam: ase 真的很龐大 07/11 21:18
13F：推 huuban: 看實驗目的吧..廠商能出圖表但不見得是你們想要的東西啊 07/11 22:07
14F：推 lingon: 不會做生資別花錢做RNASeq, 廠商的分析也不要太信 07/11 22:22
15F：推 jabari: 其實我想說RNAseq退流行了 現在有protein scan的... 07/11 22:27
16F：→ blence: 應該先問,你想得到怎樣的data,以及只有RNAseq能解決問題? 07/11 23:00
17F：→ blence: 現在已經有許多OA data,廠商能給的也不脫離這些內容,如果 07/11 23:03
18F：→ blence: 你真的想送樣,至少先知道後續會遇到的困難 07/11 23:06
19F：推 Alstonia: 先決定你要用的平台跟分析的方向或者有paper可以當範本 07/11 23:37
20F：→ Alstonia: 舉例，再看看你預算的上限是多少，拿著這些去跟廠商討 07/11 23:38
21F：→ Alstonia: 論。如果完全沒經驗的話建議跟樓上先進說的一樣找人合作 07/11 23:38
22F：→ Alstonia: ，data產出後面的工作還很多，很難錢丟了就解決， 07/11 23:38
23F：推 Alstonia: 講具體一點就是可以先想想你的論文或報告裡希望能畫出 07/11 23:48
24F：→ Alstonia: 怎樣的圖跟比較表，把這些需求同時跟廠商討論這樣會比 07/11 23:48
25F：→ Alstonia: 較清楚。 07/11 23:48
26F：推 Alstonia: 然後在台灣自己有機器自己跑的也還不少家，被對岸價格 07/11 23:52
27F：→ Alstonia: 壓著打就是了。 07/11 23:52
28F：推 BGG: 要不要先做QPCR array看看mRNA表現量差異 07/11 23:58
29F：推 jabari: 先問清楚 這個計畫一定得跑RNAseq嗎? 還是他已經寫死 你一 07/12 00:02
30F：→ jabari: 定得上... 或者是你們有候選基因了 只是跑一下到時候其中 07/12 00:03
31F：→ jabari: 報告好過關 因為這個坑很大啊...沒有生資背景的拿到會被騙 07/12 00:03
32F：→ jabari: 很大 07/12 00:03
34F：→ lingon: 你跟老闆從第28張開始看,看不懂的話做RNASeq很容易被騙 07/12 00:46
35F：→ lingon: 至於protein scan目前還只是炫而已...而且用途不同 07/12 00:48
36F：推 lingon: 雖然能夠很直接量蛋白量,但能量到的蛋白還是有限,準度也.. 07/12 00:54
37F：推 jabari: 我認識一位受害者...欸 老闆你來啦?? 07/12 03:31
38F：→ sunorange: 廠商都很雷，給的東西完全不能用 07/12 17:12
39F：→ sunorange: 我們後來都自行分析了，如果沒有分析能力 07/12 17:13
40F：→ sunorange: 建議不要做，浪費錢而已 07/12 17:13