作者chobittcu (好餓><)
看板Biotech
標題[求救] Human Rat Mouse共用primer設計請益
時間Mon Oct 19 10:23:26 2015
各位板友前輩先進大家好
想請問一下qPCR primer設計的問題
手上有抓到Roche的軟體,但是實驗室不是roche的系統,是什麼MJ research的
想要對Rat、Mouse、Human三種細胞中抽出的RNA去定量TLR-4的表現量
因為之前都是用實驗室學長姊留下來的或是現成的
第一次設計qPCR的primer
如何用Roche的軟體搭配NCBI設計多種物種間共用的primer呢?SYBR Green用的
因為是新手,如果能越詳細越好,感謝<(_ _)>
往前爬文好像有說可以從廠商的database找,那要怎麼找呢?
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 114.33.136.42
※ 文章網址: https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/Biotech/M.1445221408.A.DD2.html
※ 編輯: chobittcu (114.33.136.42), 10/19/2015 10:23:41
※ 編輯: chobittcu (114.33.136.42), 10/19/2015 10:27:30
1F:推 michealking: Roche 有qpcr 的primer 設計網頁 10/19 13:23
2F:→ michealking: 找到頁面選物種後丟NM碼就可以了 10/19 13:24
3F:→ chobittcu: 可是這樣只能找出一種物種,我要如何找出三個物種通用 10/19 17:53
4F:→ chobittcu: 都認得到的primer呢,感謝 10/19 17:54
5F:→ a90648: 先把三種的序列對照一下找consreve的地方設計primer啊 10/19 21:52
6F:推 jsi: primer blast網頁可設定多個物種為參數,搜尋適合的primer 10/21 00:50
7F:推 ararthur: 不能設計三組嗎? SYBR Green要做通用的我認為真的太難 10/21 11:10
8F:推 michealking: 答 我習慣不同物種分開,然後我是用UPL 10/21 23:45