作者orzman17 (God Bless Taiwan)
看板Biotech
標題[求救]CHIP 完之後 設計Primer 跑q-PCR
時間Fri Mar 20 00:01:39 2015
目前CHIP完純化好DNA
也找好預測定的基因片段序列
可是設計primer 似乎要在 預測定的基因片段的promoter上
NCBI上在預測定序列 往前推了1000 base 找了很久
找不出來哪裡是promoter 也不知道primer怎麼設計 囧
補充:預測定基因是Prox1 物種是Rat
請各位大大 協助 小弟在此謝過> <
※ 編輯: orzman17 (1.175.170.211), 03/20/2015 00:51:52
1F：→ blence: 對於這類的問題,如果是找"TF貼在哪段promoter"為實驗目的 03/20 01:28
2F：→ blence: 究竟是reporter assay,還是用ChIP比較會優先考量？ 03/20 01:29
3F：→ blence: 我是覺得reporter簡單,可是會你不知道prom就應該是沒做過? 03/20 01:32
4F：推 yuyu219: reporter是另外送進去的plasmid，方便，但不一定是真實 03/21 16:51
5F：→ yuyu219: 狀況，ChIP會較貼近實際狀況，會做ChIP通常應該是想看his 03/21 16:51
6F：→ yuyu219: tone modification 03/21 16:51
7F：→ blence: ChIP是想呈現直接bind證據,用TF直接IP就好,無關histone阿 03/21 19:31