作者goodday06 (goodday)
看板Biotech
標題[討論] 植物基因重複的問題
時間Sun Feb 15 15:07:08 2015
小弟在分析序列資料
在比對過程中發現植物基因重複的現象似乎非常誇張
常常相同的基因，coding sequence也完全相同
卻出現在許多不同的染色體位置
由於我本來不是做植物
突然覺得好扯...
印象中動物沒這麼誇張
想請問有沒有人有概念
植物的基因
在基因體中完全不重複的比例?
我是說大多基因都會在基因體中重複嗎?
相同基因平均會在基因體中重複幾次?
先謝謝分享!!!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.89.55
※ 文章網址: https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/Biotech/M.1423984031.A.B5E.html
1F：→ Ianthegood: 這種狀況在選汰壓力越小的物種會越明顯 講平均什麼沒 02/15 15:51
2F：→ Ianthegood: 什麼意思 02/15 15:51
3F：→ goodday06: 所以應該說 植物的基因大部分都有重複囉... 02/15 15:57
4F：推 leptoneta: 通常植物多倍體會長的比二倍體更好更有競爭力 02/15 23:27
5F：推 jabari: 剛轉植物這問題很正常 植物多倍體很常見 02/16 02:04
6F：推 jabari: 好像香蕉就三倍體的樣子@_@ 你想想他們都能亂嫁接了 02/16 02:07
7F：→ goodday06: 我覺得誇張的不只是多倍體的問題 02/16 09:16
8F：→ goodday06: 而相同基因 出現在不同號碼的染色體很多次 02/16 09:17
9F：→ goodday06: cds 序列都一樣 卻重複出現在不同號碼的染色體位置 02/16 09:17
10F：→ goodday06: 最近我用ensmbl plant看玉米基因 看到這樣的情形 02/16 09:19
11F：推 nike77114: 因為->芭芭拉·麥克林托克<- 02/16 14:05
12F：→ Ianthegood: 這本來就是很common的現象 只是你之前做的model剛好沒 02/16 16:16
13F：→ Ianthegood: 有吧 02/16 16:17
14F：推 jabari: 原來是個跳跳基因啊.. 02/16 16:56
15F：→ Ice9: 人類性染色體上就有誇張的重複基因，不過，就只是在性染色體 02/25 18:42