作者penguinbb (penguin)
看板Biotech
標題[討論] Qubit v.s. nanodrop測dna濃度
時間Wed Jan 14 21:13:07 2015
我想大家都知道nanodrop測濃度沒有qubit準
一個靠吸光值一個是靠dye binding dsDNA
因此若要準確地知道濃度 大部份都是用qubit測 尤其是送NGS的wgs
但是有時候
我們lab出現qubit > nanodrop的情形 ex. qubit(300), nanodrop(90) ng/ul
260/280. 260/230的值都很好大約2上下
那些是genomics dna, 是要送ngs的
跑膠因為太大所以卡well也看不太出來
最後送ngs是都沒問題
只是我很好奇
什麼樣的情形qubit的值會比nanodrop高
不曉得有沒有人有類似經驗？
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1F：推 jabari: DNA送NGS幾乎都沒太大問題 RNA比較麻煩 01/14 21:56
2F：→ jabari: 之前有過qubit比較高...不過送了也沒事就不想管了XD 01/14 21:59
3F：→ Ianthegood: 不可質疑你的 Qbit(誤 01/15 11:17
4F：推 jabari: btw 我翻了一下上一次送ngs的 nano測296ng qubit只有25ng 01/15 16:23
5F：→ jabari: 然後用Agi2100的DNA kit測QC .. 只有16.95ng 囧a 01/15 16:25
6F：→ penguinbb: 謝謝j大分享！看來這個問題應該是無解了 01/17 21:51
7F：推 supray: 有發生過換人測 紀錄的值總是異常高 01/19 08:39
8F：→ supray: 結果是沒選單位跟測量體積.... 01/19 08:39
9F：→ supray: 如果是HS那組 1ul 最高只能測到120ng/ul 01/19 08:41
10F：→ supray: 計算濃度前的讀值是 600ng/ml 01/19 08:42
11F：→ supray: 差5倍... 01/19 08:44
12F：→ supray: 另一種情況是Nanodrop測不出來沒濃度 但qubit測得出 01/19 08:45