作者spcat (spcat)
看板Biotech
標題[求救] 蛋白質下降但promoter activity卻上升
時間Tue Jul 16 11:12:38 2013
大家好:
想請教一個目前遇到的問題
前提如下:
ABCD皆有x y protein
在A cell 加入si-RNA x---會看到y protein上升
在B C D cell加入si-RNA X---則看到y protein 下降
於是construct約-2kb~~+1 promoter
promoter加si-RNA x--into A and B cells
卻看到在A 裡面promoter activity下降
B 裡面promoter activity上升
請問大家有遇過這種問題嗎? 還是有看過類似的paper
謝謝
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 211.76.175.170
※ 編輯: spcat 來自: 211.76.175.170 (07/16 11:13)
1F：→ spcat:題目寫錯了~~promoter activity上升 07/16 11:15
2F：→ Ianthegood:大T改題目 07/17 00:36
3F：→ Ianthegood:有點不清楚 x跟X一樣嗎? x的target是? promoter是誰的? 07/17 00:38
4F：→ Ianthegood:into是transfect還是stable clone還是? 07/17 00:38
5F：→ Ianthegood:activity的測量方式? control? 07/17 00:38
6F：→ spcat:謝謝~~x等於X(筆誤)猜測y會受x影響 因此做y promoter 07/17 09:57
7F：→ spcat:transient transfect然後control是送pGL3加同樣的siRNA 07/17 09:59
8F：→ spcat:測量是用promega dual-luciferase system 謝謝 07/17 10:00
9F：推 poison7202:Off target 無解... 07/17 12:58
10F：→ xxtomnyxx:你的promoter有reference嗎？ +1是基於CDS還是TSS? 07/18 00:41