作者bbbjjj (wind)
站內Biotech
標題[求救] Primer設計
時間Thu Nov 1 20:10:01 2012
大家好 日前被老闆指派設計 Real time-PCR primer
去偵測出sample (tissue or cell)中target的表現量變化
想請問大家 若target為VEGFA 從NCBI搜尋中發現
它具有非常多種不同的transcript variant form
那我是要選擇哪一種form 來進行接下來的primer設計呢?
謝謝大家~
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 122.121.251.85
1F：→ mzac1b:你可以參考生技公司的產品來設計 會方便很多 11/01 20:12
2F：→ mzac1b:設計引子還要考慮跨exon的問題 直接參考別人設計的 11/01 20:13
3F：→ mzac1b:如taqman gene expression 的產品 整理的還不錯 11/01 20:14
4F：→ bbbjjj:謝謝你 我會試試看~ 11/01 20:16
5F：推 qqmango:直接參考paper最快，但還是要blast試試 11/01 20:22
6F：→ bbbjjj:謝謝 我試試看 11/01 20:25
7F：→ Locutus:taqman probe的primer sequence可以查的到嗎? 11/01 23:52
8F：推 davideason:商用販賣的引子 往往是不會給序列滴 11/02 01:00
10F：→ jsi:參考看看 11/02 01:32
11F：→ bbbjjj:謝謝大家的回答~ 11/02 09:38
12F：→ mzac1b:商用不給序列 不過他有整理起來 參考哪個序列 11/02 12:11
13F：→ mzac1b:跨哪兩個exon 推薦引子位置 還是可省時間 雖然沒買... 11/02 12:12
14F：→ mzac1b:因為若自己整理 光isoform一堆就有點頭痛 11/02 12:13
15F：推 jabari:我都查qiagen的 他會寫是用哪一區或exon-exon 設計 11/02 14:46
16F：→ jabari:如果你用R牌機器..可以跟業務要primer設計軟體..很好用喔~ 11/02 14:48
17F：→ bbbjjj:謝謝~~ 真的幫助很大 11/02 15:22