作者ckr (琴心)
看板Biotech
標題[求救] 請教realtime PCR 定量
時間Wed May 30 08:58:04 2012
最近在整理 PCR資料的時候想到的問題
如果實驗本身做了三重複 得到三個cDNA sample (a, b, c)
接著PCR對每個sample做三重複,2^-dct method 得到9個資料點
(a1, a2, a3, b1, b2, b3, c1, c2, c3)
請問各位板友,下面三種資料呈現方式哪一個比較正確呢?
1. 選擇三次實驗中具代表性的一次,如(a1+a2+a3)/3±SD, n=3
2. (a1+a2+a3+..+c1+c2+c3)/9±SE, n=9
3. 取三次實驗各自的平均值,a', 'b, c',接著以(a'+b'+c')/3±SE, n=3
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 75.180.45.69
1F:推 williamyang:若是實驗結果趨勢是一至的,選1 05/30 14:20
2F:推 icehikki:我都用二 05/30 15:18
3F:→ blence:如果是上述cDNA定量,用1.是測你的機器的mechanistic error 05/30 15:56
4F:→ blence:做100次也沒有意義,應該用3.才能比較代表三次exp的error 05/30 16:01
5F:→ blence:至於其它實驗端看你計算平均值時想要呈現的SD代表什麼意義 05/30 16:03
6F:→ ckr:謝謝三位板友的意見 05/30 19:20
7F:推 qqmango:2是錯的,應該是用3,1的話會有主觀選擇的偏差問題 05/31 01:24
8F:→ ckr:謝謝q板友的說明 05/31 09:53
9F:推 bigtuna:3不知會不會把"人為誤差"給忽略了,用2似較能算進人為誤差 06/03 01:55
10F:→ bigtuna:不過不是很確定,也想要和大家一起討論:) 06/03 01:58
11F:推 ararthur:1才是錯的吧... 06/12 16:56
12F:→ ararthur:嚴格來說 3才是最正確的 但也會是SD最大的 所以大部分人 06/12 16:57
13F:→ ararthur:可能會從a1 a2 a3的數據當中看看是否有偏差過多的予以刪 06/12 16:58
14F:→ ararthur:除 然後再從a' b' c'去統計 06/12 16:58