作者mkmai0802 (Wengda)
看板Biotech
標題[求救] 請問如何找出各種物種的Highly conserved sequence ?
時間Thu Sep 15 22:32:16 2011
請問
我現在如果找到一個突變點
我們教授說要像有些Paper一樣
比較這個點 在各物種間是否具有高度保留的情況
如果有的話 代表 如果發生突變就會導致比較嚴重的情況
可是他也沒告訴我 如何找出來所有物種
我有到UCSC網站找到幾個
不過我只找的到他排出來的5-6種
不過我們老師 要至少10幾種 -.- ??
他說不夠不夠 .......
請問要怎樣找到各物種的序列並且像paper一樣排列出來 ??
我有想過用BLAST = =? 是這樣嗎 ??
--
我愛妳 用生命的愛 ~
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 203.64.76.142
1F:→ huuban:NCBI,BLAST,出來的序列可以自己下載再用軟體排 / \ 09/16 00:41
2F:推 rom1025:ensembl也有 09/16 10:10
3F:推 captdavince:你需要的是找到所有的物種然後再clustalW排一起 09/16 14:31
4F:推 Ice9:推captdavince的方法 09/17 18:35