作者CD133 (迷思)
看板Biotech
標題如何預測protein binding site?
時間Wed Mar 16 11:13:51 2011
我手上有一的蛋白,我有他的amino acid sequence
我想要知道這個蛋白有沒有可能的binding site可以與其他的蛋白進行interaction,
我想要找一些生物資訊軟體,可以幫我作預測分析。
可不可以請大家給一點建議?謝謝
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.253.121
1F:→ hwjuranus:或許可參考交大生資所楊進木老師網頁 03/16 12:41
2F:→ inchew:NCBI sequence blast,找高序列相似度蛋白,比對其已知的 04/06 19:01
3F:→ inchew:binding site 04/06 19:02
4F:→ inchew:如果interaction protein有對象了的話,docking modeling 04/06 19:03
5F:→ inchew:沒做過 聽說docking不好作 (以上純屬個人淺見 04/06 19:03