作者yawai (小狐)
看板Biotech
標題[求救] signal peptide 判定
時間Mon Jan 10 11:47:06 2011
目前小妹我在做的是 promoter的實驗
老師說要先找signal peptide 或是5' UTR
才能確定從哪邊開始算是promoter 大概要往上游走1.5k~2K左右
雖然找到了預測的網站 signalP:
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
我完全不會用 @@ 有試著把定序回來的序列轉成a.a後貼上去
可是完全沒有出現可能的位置(就算有 數值也很低)
用promoter預測網站也是 得到的數值都不高.....
(
http://molbiol-tools.ca/promscan/)
有沒有高手可以教那個signalP的網站要怎麼用
或是有其他的資料庫可以作比對的(signal peptide 或5' UTR 都可以)
先謝謝大家了
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.127.37.143
1F：推 lingon:SignalP 直接跟dtu 他們要stand alone, 那一個比較準 01/11 11:22
2F：→ yawai:什麼是dtu @@? 01/11 12:13
3F：推 lingon:Denmark Tech. Univ. 作者的學校 01/12 06:42
4F：→ yawai:喔~ 感謝!! 01/12 10:11