作者bluenile (閒來無事)
看板Biotech
標題[求救] real time PCR primer設計
時間Fri May 28 13:58:36 2010
大家好
我最近要設計兩組realtime primer
但這兩個都是屬於相似度頗高的transcription factor family
我用Beacon disgner設計
primer長度在70~200bp
但真的找不到QQ
我想問一下
為何長度不可超過200
是因為2 step 的program的關係嗎
如果我用3 step 的
是否可以長一些
又
我可以一邊primer在homologous區內
一邊primer在specific區內嗎@@
又
如果真的不行做realtime
那上述的方法(一邊primer在homologous區內 一邊primer在specific區內)
口以嗎QQ
煩請大家幫幫忙QQ
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◆ From: 140.112.52.105
1F：推 datro:長度超過兩百的複製效率會不趨近於二 05/28 15:14
2F：→ bluenile:soga 是因為太長了嗎? 05/28 15:46
3F：推 datro:我突然想問 您不會是想兩組primer能一起跑real-time 且分辨 05/30 02:52
4F：→ datro:還是想要避免A B會有Cross reaction？ 若是後者 specific 05/30 02:53
5F：→ datro:primer 3'base變成有差異就好 05/30 02:54
6F：→ bluenile:其實是我之前有用P出來約300bp的primer組合 05/31 00:43
7F：→ bluenile:但害怕太長會影響結果，所以有考慮要不要重訂primer XD 05/31 00:44