作者katty7389 (被風吹跑了~)
看板Biotech
標題[求救] western的internal control 調不勻
時間Tue Nov 10 10:24:36 2009
大家好我是做western blotting的新手
最近實驗遇到瓶頸.想請大家幫忙
最近我在做KB跟L30 protein的表現
可是發現每次壓出來的internal control都不均勻
(我有分fraction, cytoplasm是壓b-tubulin. nucleus是壓lamin B)
我猜想幾個可能造成的原因
1.收細胞時,medium去除不乾淨 影響定量的結果
2.收細胞時 兩個細胞收的量不太一樣 影響定量結果
3.因為我把sample跟sample buffer加在一起之後去加熱.在loading到SDS-PAGE
時發現體積會比原本兩者混在一起的體積還少.我覺得自己使用pipette的技術
沒有問題.我在想會不會是這個環節有問題
因為只是猜測 不確定是哪邊出了問題
不過因為問題沒有解決 我有點害怕進行下一個實驗 所以想請大家幫我看看
這邊附上我收細胞到loading sample的流程 請大家幫我指正
1。用trypsin打下細胞。離心12000rpm 去除medium再用PBS wash一次
2。離心 去除PBS
3.用0.4M LYSIS buffer I與cell pellet mix
4。on ice 15 min
5.加入10%np40 votex後離心13000rpm 取上清液即為cytoplasmic extract
6.加入lysis buffer II與cell pellet mix
7。15分鐘內 約每1分鐘vortex 10秒
8。離心13000rpm 取上清液即為nucleus extract
9.將取得的sample做定量
10。定量的結果假設為2.41μg/μl,我每個well想loading 40μg.就加
16。5μl的sample與4μl 6x的sample buffer混勻(無論多少sample
都加4μl的sample buffer)
11.100度煮protein 10分鐘
12。loading sample
有錯麻煩大家指正 謝謝
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◆ From: 211.76.175.139
1F:→ DFS:收細胞我都用刮的 RIPA加下去後就刮刮刮 然後12000g離心 11/10 12:45
2F:推 icome:我是整管sample加buffer全部調成一樣濃度 跑膠load一樣體積 11/10 13:36
3F:推 icome:你取小體積配置的風險是 有一點點沾黏或誤差就會影響很大 11/10 13:38
4F:→ katty7389:所以如果是直接加想要的蛋白質量而不是全部調成一樣 11/10 14:30
5F:→ katty7389:誤差會比較大的意思嗎? 11/10 14:31