作者rvnkhlnomgtl (或許天堂也常日落)
看板Biotech
標題[討論] 定序之band的位置
時間Mon Jul 14 09:49:28 2008
話說在前面~我是做植物實驗的!
那天我在試定序實驗時發現,同一個primer 但不同物種的定序,出來的band位置有
些微的差距(約1-200bp)......
所以有沒有可能不同物種有band位置不同的差異呢?還是我其中一個物種的條件設
錯了呢?
不好意思,我在定序方面是個新手~請大家指教~謝謝!
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遺憾提醒我們曾經幸福的可能
但 我們畢竟是錯過了!
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 211.75.55.226
1F：推 bonbonyaho:定序自己定喔? 07/14 12:22
2F：→ rvnkhlnomgtl:不是哦~拿去拿別人定,只是我會先跑膠看位置! 07/14 13:49
3F：推 turtle24:所以你用primer去做PCR? 07/14 14:02
4F：推 MrCAKE:樓上應該是正解...... 07/14 14:48
5F：→ MrCAKE:如果是這樣的話 不同物種片段有大小差異是很正常的 07/14 14:49
6F：→ rvnkhlnomgtl:我的意思是由照片上看起來位置不太一樣 07/14 15:01
7F：→ rvnkhlnomgtl:不是由定序公司解出來長度的差異哦~ 07/14 15:02
8F：推 ookubo:照片上位置不同? 定序回來的長度卻相同? 不是這樣吧? 07/14 19:06
9F：推 chvkimo:有可能阿!PCR product片段 剛好在不同物種有差異的區域 07/14 20:55
10F：→ chvkimo:但是要跟你的定序結果比對看看 合不合 07/14 20:56
11F：推 ookubo:把序列上NCBI比對，可以和已發表物種的序列比較identity 07/14 21:38
12F：→ ookubo:也可以知道不同物種之間相同基因的差異... 07/14 21:39
13F：推 sGoat:不同物種的同源基因還是會有不同,所以是正常的 07/15 10:42