作者rvnkhlnomgtl (或许天堂也常日落)
看板Biotech
标题[讨论] 定序之band的位置
时间Mon Jul 14 09:49:28 2008
话说在前面~我是做植物实验的!
那天我在试定序实验时发现,同一个primer 但不同物种的定序,出来的band位置有
些微的差距(约1-200bp)......
所以有没有可能不同物种有band位置不同的差异呢?还是我其中一个物种的条件设
错了呢?
不好意思,我在定序方面是个新手~请大家指教~谢谢!
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遗憾提醒我们曾经幸福的可能
但 我们毕竟是错过了!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 211.75.55.226
1F：推 bonbonyaho:定序自己定喔? 07/14 12:22
2F：→ rvnkhlnomgtl:不是哦~拿去拿别人定,只是我会先跑胶看位置! 07/14 13:49
3F：推 turtle24:所以你用primer去做PCR? 07/14 14:02
4F：推 MrCAKE:楼上应该是正解...... 07/14 14:48
5F：→ MrCAKE:如果是这样的话 不同物种片段有大小差异是很正常的 07/14 14:49
6F：→ rvnkhlnomgtl:我的意思是由照片上看起来位置不太一样 07/14 15:01
7F：→ rvnkhlnomgtl:不是由定序公司解出来长度的差异哦~ 07/14 15:02
8F：推 ookubo:照片上位置不同? 定序回来的长度却相同? 不是这样吧? 07/14 19:06
9F：推 chvkimo:有可能阿!PCR product片段 刚好在不同物种有差异的区域 07/14 20:55
10F：→ chvkimo:但是要跟你的定序结果比对看看 合不合 07/14 20:56
11F：推 ookubo:把序列上NCBI比对，可以和已发表物种的序列比较identity 07/14 21:38
12F：→ ookubo:也可以知道不同物种之间相同基因的差异... 07/14 21:39
13F：推 sGoat:不同物种的同源基因还是会有不同,所以是正常的 07/15 10:42