作者aflyingfish (飛魚)
看板Biotech
標題[方法] 請問除了in gel digest以外還有其它的方式嗎？
時間Mon Jun 16 11:44:05 2008
想請教一下
我用ingel digest的方式得到peptide之後要去打mass
結果我剛才才發現我的protein sample，為一個大約200個胺基酸長的protein
並不存在Lysine(K)這個胺基酸
而ingel digest 是用trypsin做酵素切割，是必須認R 跟K這兩個胺基酸
如果說我的protein sequence裡頭不存在K的話，是不是就代表用ingel digest
無法進行呀？
如果真是如此的話，還有其它的方式做MS分析嗎@@"
之前完全沒碰過蛋白質鑑定，跟別人要了實驗步驟就做下去了..沒查清楚> <"
麻煩大家給個建議 謝謝！
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◆ From: 192.192.90.35
1F：推 blence:可以找其他能用的酵素來切，不一定要用trypsin 06/16 13:42
2F：推 leoblack:pepsin不也可以?!只是打msaa時要註明~ 06/16 14:22
3F：推 witchs:不是還有R嗎？ 最好切位是正電荷胺基酸 Mass比較好打 06/17 20:49
4F：→ witchs:R and K ，有其中一個即可 06/17 20:50