※ 引述《[email protected] (讓開!!肥兔來了!!)》之銘言： : 找到一篇PAPER但上面的方法用的是大鼠的primers : 我這邊用的卻是小鼠= =" : 請問各位大大 : 二者的primers可以共用嗎? 在此推薦NCBI的electronic pcr軟體 他有兩種方向(forward/reverse)的使用法 forward e-PCR是根據所提供的DNA sequence或是accession number尋找STS reverse e-pCR是根據所提供的STS尋找可Mapping到的sequence 在這個例子中可以使用reverse e-PCR 點進去後先在上方dataset選擇你是要小鼠的transcriptome還是genome 然後我習慣使用table input 輸入Label(你給的命名), First primer, second primer, size(預計的大小) 底下的STS size deviation以及alignment quality就看你希望的嚴謹程度調整 我個人建議都使用最大值以得到最多的可能性 按下search後等他呈現結果 若是hit數為零,則可能在你的嚴謹程度條件下該primer放大不出預計size的片段 若是有hit到,則可觀察missmatch以及gap的程度而得知該primer的專一性 這個軟體目前內建有人類、大小鼠、果蠅、阿拉伯芥等8個物種的資料 提供你做參考 --

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