作者danielsfh (大頭)
看板Biotech
標題[求救] 關於microRNA microarray 和 real-time PCR 的問題
時間Fri Apr 18 01:52:18 2008
我是利用invitrogen 出的 NCode microRNA microarray
來偵測癌細胞和正常細胞內 microRNA表現的差異
再利用ABI 公司的 Taqman real-time PCR 來comfirm
可是real-time PCR的結果 和array 卻是大大的不同
有的甚至是相反的或是表現沒有什麼差異性
我做了八個microRNA 幾乎都是這樣
sample是病人的檢體和老鼠
總共做了十片的array
請教一下各位
有人知道原因是什麼嗎
或是可以給我什麼建議
謝謝~~~~~~
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 125.231.210.136
1F：推 freesoul:一樣的sample，我會相信real-time PCR的結果 04/18 05:05
2F：→ freesoul:array出來的東西誤差很大的 04/18 05:05
3F：推 soom:我們家也是遇到這個問題.. microarray跟PCR R < 0 04/18 12:18
4F：推 soom:後來我們就不管nCode了 array改用別家的 04/18 12:20
5F：推 jjlee:NCode的數據正規化是問題所在, 沒有可挽救的方法 04/18 19:18
6F：→ jjlee:找oligo probe的, 會比NCode打點好很多.. 04/18 19:19
7F：推 justwhite:array因normalise條件不同 結果也會不同 qPCR較準+1 04/18 20:43
8F：→ danielsfh:謝謝大家給我的回答 那目前我最好的方法 是不是就是直接 04/18 21:24
9F：→ danielsfh:放棄array的結果了 04/18 21:25
11F：→ ccfccf:miRNA signature predicts survival and relapse in Lung C 04/19 00:29
12F：→ ccfccf:Cancer Cell. 2008 Jan;13:48-57. Yang PC 04/19 00:31
13F：推 pinpin:NCode要做normalization真的是個問題 j大能否分享一下心得 04/19 14:26
14F：→ danielsfh:我看過Yang PC先生的那篇PAPER了 聽說 砸了一千多萬做的 04/19 17:43