作者kiwicc ()
看板Biotech
標題[請益] 如果Primer的GC contant太高會怎麼樣嗎？
時間Wed Jan 9 10:03:22 2008
如題，最近要設計一對Primer～基本上Forward的地方沒有什麼問題，
但是要設計reverse的那個片段GC contant非常高，若以20 bp裡面GC就佔了70%以上。
請問如果Primer的GC contant高出70%以上會造成什麼不良影響嗎？？？
還是說頂多就是黏合溫度設定高一點而已？ 謝謝
PS.我要增幅的片斷預計是450~475 bp
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幸福 應該是建立在彼此的信任 而不是金錢的依賴
是讓彼此做對方的第二雙手 而不是要對方當隻聽話的狗
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◆ From: 140.120.196.232
1F：推 sinwam:PCR時會容易打不開,可能會做不出來或是不漂亮!! 01/09 10:21
2F：推 silverberry:加 DMSO 可以讓二級結構比較容易被解開~~ 01/09 11:02
3F：→ silverberry:之前有做過 GC 佔 85% 左右的~~ 還蠻 ok 的^^ 01/09 11:03
4F：推 sGoat:通常會要求primer pair之間GC值不要差太大,GC高就要一起高 01/09 11:30
5F：→ sGoat:不過還是做得出來,但是與其去try條件,不如在一開始就設計好. 01/09 11:33
6F：推 sGoat:另外要是你用DNAMAN設計的話,primer數值不是worth都可以P出 01/09 12:36
7F：→ sGoat:打錯...是primer select,不是DNAMAN =.= 01/09 12:38