作者gwendiline (丹丹)
看板Biotech
標題[求救] 關於設計RT-PCR primer?
時間Tue Jan 1 16:19:45 2008
之前老師有設計一些關於植物某種酵素的RT-PCR primer
是從許多模式植物中 取得較conserve的sequence而設計的
現在問題來了..
我發現這樣的primer在我的植物材料中
釣出來卻是chloroplast的基因..= =
Any way~ 先不論這樣的序列對於我的材料有什麼意義
我也希望在畢業前能有個明確的結果
因此 我希望能重新設計primer..
不過 問題來了
我到NCBI 輸入許多親源性較近的物種
找到他們的mRNA序列~
然後 希望獲得共同的一些序列
來設計幾支primer~
不知道有哪位大大能告訴我T T
獲得mRNA序列後接下來該怎麼做...
是兩兩比對嗎 或是有更快的方法?
還有 取得後
R primer、 F-primer該怎麼設計?
麻煩各位解答了
先謝謝各位~^^
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◆ From: 140.120.192.30
1F:推 huangsw:vector NTI 應該可以勝任你想要的工作 01/01 16:57
2F:推 dankai:你可以用clustalw 多序列比對~比較快! 01/01 18:12
3F:→ gwendiline:感謝大家給我的解答及來信>////< 真不好意思.. 01/02 12:17
4F:→ gwendiline:實在是因為我是我們實驗室目前唯一有做到分生部分的學 01/02 12:18
5F:→ gwendiline:生...自己也不好意思小事情也問老師..所以只能來這裡求 01/02 12:18
6F:→ gwendiline:救 真是非常謝謝大家~~好熱心唷^^ 01/02 12:18