作者coolboychiu ()
看板Biology
標題[問題] recombinase 重組酶 DNA inversion
時間Sat Apr 30 04:05:34 2016
【問題】：
我們知道有些重組酶像phiC31可以產生不可逆的DNA翻轉，圖示如下
attP >^^^^^^^^> attB (>^^^^^^^^> 表示一段被attP和attB夾住的DNA序列)
|
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V
attR <vvvvvvvv< attL (v 代表 ^ 反轉後的樣子)
如果現在DNA上有多組相同的attP-attB pairs，如下圖
attP_1 >^^^^seq 1^^^^> attB_1 ~~~~~~~~ attP_2 >^^^^seq 2^^^^> attB_2
(~~~~~~~~代表中間不重要的DNA序列 可長可短)
我在想這樣的結構應該attP_1和attB_2夾住的整個DNA序列也有機會整個被翻轉
我想請問各位的是：
seq 1和seq 2個別被翻轉的機會會遠比整個序列一起被翻轉大得多嗎？
【問題起因】：
研究上碰到的
但我本身其實是念電子 老闆有興趣 我就被叫來做相關研究了
我已經查了一整天資料 但毫無所獲 到現在都還沒睡覺QQQQ
所以才想上來請問大家
如果有參考資料 方便的話 麻煩各位在提供給小弟了
沒有也沒關係
先謝謝大家了
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1F：→ blence: 你把P,B,R,L的1跟2的ATCG序列拿來比對是怎麼轉變就了解了 04/30 10:59
2F：→ blence: P1B1可轉成R1L1,但P1B2轉不出可用的R?L?阿 04/30 11:03
3F：→ coolboychiu: 謝謝樓上回答。但我是假設兩組attP和attB一模一樣 下 04/30 12:15
4F：→ coolboychiu: 標1和2只是方便讓我解釋問題 那這樣attP1和attB2應 04/30 12:16
5F：→ coolboychiu: 該也可以變成attR和attL吧？ 04/30 12:16
※ coolboychiu:轉錄至看板 Biotech 04/30 21:11
6F：推 oyl158: 答案是肯定的 如果在假設Recombinanse的效率沒有距離的影 05/05 05:09
7F：→ oyl158: 響下。翻轉的可能有四種，frag1+2, frag1, frag 2，都不 05/05 05:09
8F：→ oyl158: 轉. 中間兩者只要其中一個發生另一個就會接著發生，中間 05/05 05:10
9F：→ oyl158: 兩者只要其中一個發生第一種情況也不會發生，所以個別翻 05/05 05:10
10F：→ oyl158: 轉的機率會比較同時翻轉高。都不轉的情況是中間兩個attB a 05/05 05:10
11F：→ oyl158: ttP發生互換 05/05 05:10