作者coolboychiu ()
看板Biology
标题[问题] recombinase 重组酶 DNA inversion
时间Sat Apr 30 04:05:34 2016
【问题】：
我们知道有些重组酶像phiC31可以产生不可逆的DNA翻转，图示如下
attP >^^^^^^^^> attB (>^^^^^^^^> 表示一段被attP和attB夹住的DNA序列)
|
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V
attR <vvvvvvvv< attL (v 代表 ^ 反转後的样子)
如果现在DNA上有多组相同的attP-attB pairs，如下图
attP_1 >^^^^seq 1^^^^> attB_1 ~~~~~~~~ attP_2 >^^^^seq 2^^^^> attB_2
(~~~~~~~~代表中间不重要的DNA序列 可长可短)
我在想这样的结构应该attP_1和attB_2夹住的整个DNA序列也有机会整个被翻转
我想请问各位的是：
seq 1和seq 2个别被翻转的机会会远比整个序列一起被翻转大得多吗？
【问题起因】：
研究上碰到的
但我本身其实是念电子 老板有兴趣 我就被叫来做相关研究了
我已经查了一整天资料 但毫无所获 到现在都还没睡觉QQQQ
所以才想上来请问大家
如果有参考资料 方便的话 麻烦各位在提供给小弟了
没有也没关系
先谢谢大家了
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1F：→ blence: 你把P,B,R,L的1跟2的ATCG序列拿来比对是怎麽转变就了解了 04/30 10:59
2F：→ blence: P1B1可转成R1L1,但P1B2转不出可用的R?L?阿 04/30 11:03
3F：→ coolboychiu: 谢谢楼上回答。但我是假设两组attP和attB一模一样 下 04/30 12:15
4F：→ coolboychiu: 标1和2只是方便让我解释问题 那这样attP1和attB2应 04/30 12:16
5F：→ coolboychiu: 该也可以变成attR和attL吧？ 04/30 12:16
※ coolboychiu:转录至看板 Biotech 04/30 21:11
6F：推 oyl158: 答案是肯定的 如果在假设Recombinanse的效率没有距离的影 05/05 05:09
7F：→ oyl158: 响下。翻转的可能有四种，frag1+2, frag1, frag 2，都不 05/05 05:09
8F：→ oyl158: 转. 中间两者只要其中一个发生另一个就会接着发生，中间 05/05 05:10
9F：→ oyl158: 两者只要其中一个发生第一种情况也不会发生，所以个别翻 05/05 05:10
10F：→ oyl158: 转的机率会比较同时翻转高。都不转的情况是中间两个attB a 05/05 05:10
11F：→ oyl158: ttP发生互换 05/05 05:10