作者cryosakura (CJ)
看板Biology
標題Re: [問題] miRNA的來源？（附上文獻）
時間Sat Sep 27 09:39:40 2008
※ 引述《bxorw (每天保持微笑)》之銘言：
: 推 sGoat:原文意思是說 intron跟exon都會有miRNA 09/26 09:17
: → sGoat:intron的情形就是出現在intron上 09/26 09:18
: → sGoat:exon的情形會出現在coding reagion上還有5'與3'UTR上 09/26 09:19
: → sGoat:UTR就是UnTranslate Reahgion,這部份不會被轉譯蛋白 09/26 09:19
: → sGoat:miRNA又大多在22-25mer所以可以分布在UTR或是coding reagion 09/26 09:21
: 所以應該是這樣說
: 在會transcription成為mRNA這個部份裡面(exon)的3'UTR and 5'UTR這個二個部份。
: 是不會轉錄成為蛋白的，這個區域有發現miRNA存在(non-coding region)
: 另外就是在transcription成為mRNA時候，被捨棄的intron這個部份(non-coding region)
: 那讓我狐疑的是intron protein-coding region，這個部份是在哪裡？
: ※ 引述《bxorw (每天保持微笑)》之銘言：
: : 推 sheepfeather:因為DNA的exon不一定是protein coding region 09/26 01:16
: : 所以說應該是先將DNA理解成有non-coding gene 與protein-coding gene二部份。
: : 而這二部份皆會有intron與exon，是這個意思嗎？
小弟稍微看了一下這篇paper
文中提到一個重點:他先舉出例子說明在non-coding region的部分，有可能藉RNA polII
transcript 出一段pre-miRNAs，這段RNA不具protein gene(沒有ATG之類的)
但是卻具有miRNA gene。
在這樣的前提之下，回頭再來看他歸納出來的三種miRNA來源
first, exonic miRNA in non-coding transcription units
second, intronic miRNA in non-coding transcription units
分別指miRNA來自pre-miRNAs上的intron或exon
(這邊的intron，exon分別應是依照splicing之後的產物來定義)
third, intronic miRNA in protein-coding transcription units
就是指來自一般常見的mRNA上的non-coding region(包含UTR、intron)
小弟的理解就是這樣，有問題，請指教!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.230.87