作者cryosakura (CJ)
看板Biology
标题Re: [问题] miRNA的来源?(附上文献)
时间Sat Sep 27 09:39:40 2008
※ 引述《bxorw (每天保持微笑)》之铭言:
: 推 sGoat:原文意思是说 intron跟exon都会有miRNA 09/26 09:17
: → sGoat:intron的情形就是出现在intron上 09/26 09:18
: → sGoat:exon的情形会出现在coding reagion上还有5'与3'UTR上 09/26 09:19
: → sGoat:UTR就是UnTranslate Reahgion,这部份不会被转译蛋白 09/26 09:19
: → sGoat:miRNA又大多在22-25mer所以可以分布在UTR或是coding reagion 09/26 09:21
: 所以应该是这样说
: 在会transcription成为mRNA这个部份里面(exon)的3'UTR and 5'UTR这个二个部份。
: 是不会转录成为蛋白的,这个区域有发现miRNA存在(non-coding region)
: 另外就是在transcription成为mRNA时候,被舍弃的intron这个部份(non-coding region)
: 那让我狐疑的是intron protein-coding region,这个部份是在哪里?
: ※ 引述《bxorw (每天保持微笑)》之铭言:
: : 推 sheepfeather:因为DNA的exon不一定是protein coding region 09/26 01:16
: : 所以说应该是先将DNA理解成有non-coding gene 与protein-coding gene二部份。
: : 而这二部份皆会有intron与exon,是这个意思吗?
小弟稍微看了一下这篇paper
文中提到一个重点:他先举出例子说明在non-coding region的部分,有可能藉RNA polII
transcript 出一段pre-miRNAs,这段RNA不具protein gene(没有ATG之类的)
但是却具有miRNA gene。
在这样的前提之下,回头再来看他归纳出来的三种miRNA来源
first, exonic miRNA in non-coding transcription units
second, intronic miRNA in non-coding transcription units
分别指miRNA来自pre-miRNAs上的intron或exon
(这边的intron,exon分别应是依照splicing之後的产物来定义)
third, intronic miRNA in protein-coding transcription units
就是指来自一般常见的mRNA上的non-coding region(包含UTR、intron)
小弟的理解就是这样,有问题,请指教!
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