※ 引述《[email protected] (休息..走更長遠的路)》之銘言： : 1.mismatch repair : 2.nucleotide excision repair : 請問這兩種修補作用是什麼呢? 一般的分子生物課本 跟網路都可以找到 http://asajj.roswellpark.org/huberman/DNA_Repair/ner.html DNA修復系統主要有下列幾種： Base-excision repair Mismatch repair Nucleotide-excision repair Double strand DNA break repair Error-prone repair(SOS response) 錯配修復 (Mismatch Repair) 　Mismatch repair修正在DNA複製時產生的錯誤， 舉例來說，可能是一個C誤與A配對，或者是polymerase跳過或重複一些base， 造成1~5個unpaired bases。參與的主要酵素有：MutH、MutL、MutS MutH：會去辨識GATC sequence並接在此處。 MutL：連接MutH和MutS的蛋白，形成一complex。 MutS：辨識突變的nucleotides並與其相接。 SSB：會保護ss DNA(single strand DNA)。 　　 　　 　　 　　 　藉由MutH-MutS complex，DNA會被拉近形成了DNA loop， MutH帶有一個site-specific endonuclease，直到碰到hemimethylated GATC sequence 才會被活化。GATC endonuclease將unmethylated strand上的GATC中G的5'上切下一刀 (nick)，表示說這一個strand是要被repair的。 用DNA helicase II由3'到5'把DNA打開(unwind)，然後exonuclease I 將出錯的這一股DNA從GATC的地方吃掉nucleotides一直吃到突變的部位。 (註：如果突變的部分位於兩個GATC中間，上述nick和吃掉nucleotide的動作 也可以從有GATC的兩端進行。)最後再用DNA polymerase III和DNA ligase把空缺補起來。(註： 有時錯誤配對的地方離GATC segment 相當遠， 甚至到1000個nucleotide以上，要耗費相當多的能量來完成1個 nucleotide mismatch的repair。MutH會認識新舊股DNA， 在新股GATC中G的5'上做Nick，這個步驟很重要， 因為新舊股不能認錯是做repair的先決條件。 移除nucleotide的exonuclease activity是 在polymerase III上3'到5'exonuclease activity。) 核切除修復(Nucleotide-excision repair「以E.coli為例」) 　　 先用ABC excinuclease在DNA lesion(即發生錯誤的部分)的左右各切下數個 nucleotides(切下的數目因物種和損壞的base數目而異， 在E. coli共切掉12~13個nucleotides)再經過DNA helicase後， 含有damaged base(s)的DNA離去。 DNA polymerase I把缺少的nucleotides補上。 DNA ligase把nick補上。 　　跟Base excision-repair不同的是nucleotide excision-repair是 拿走一段oligonucleotide而非單一個BaseꄊAABC excinuclease可以切下錯誤部分的兩邊，然後整段拿走， 因為DNA polymer只涉及十幾個nucleotide的合成， 所以只要用DNA polymerase I而不需要用到DNA polymerase III， 最後當然要用DNA ligase把gate封起來。 （取自http://life.nctu.edu.tw/~mb/c30302.htm） -- ※Post by snark from nat-11.tpc.edu.tw