作者piimaila (肥仔)
看板Bioindustry
標題Re: [問題] 電腦模擬蛋白質製藥的需求?
時間Thu Nov 21 11:35:10 2013
稍微整理一下目前討論結果
如果想要廠商接受
電腦實現高通量篩選要可行必須有
1. 配體(化合物, 藥物)夠多, 也就是目標應該定在 縮小傳統HT的範圍.
2. 由於目標是1 所以速度必須遠高於廠商能夠取得的HT機器之速度.
3. 由於是縮小傳統HT的範圍故價格要低於縮小HT範圍所得到的價格效益
但是, 如果另一方向想,
如果 能找到一個各方人才的團隊(主要是生技, 資訊人員)
開發出目前市面上疑難雜症的藥物, 該症目前可能宣稱為不治之症或慢性病
當然, 不可能是治癒, 但是理論上可以控制.
舉例說明: 紅斑性狼瘡, 第二型糖尿病, 痰湿型肥胖症
該藥物群"僅"通過電腦篩選. 這樣, 這些資料是否有市場呢?
※ 引述《s122s91 (lo)》之銘言：
: 如果你用現在上市的藥,
: 用電腦模擬去算,分數一定不是最高的
: 如果把電腦設定成"上市藥物"為最高分的參數,拿來跑,設計出來的藥物,活性通常不高
: 我想這就是困境。
: 不知道到現在為止,有沒有藥物是真的由模擬出來的。
: 電腦模擬就是模擬,不一定準。
: ※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言：
: : 想請問, 蛋白質製藥預測的整體解決方案
: : 例如:
: : 利用電腦軟體預估 以下課題
: : 多醣體抑制癌症能力(中研院)
: : 這種是否有實用性和市場?
: : 或市面上已經有類似廠商?
: : 當然, 這只是預測, 不可取代人體實驗 動物實驗等
: : 但可以大量的減少實驗範圍.
: : 弊人想投資類似公司, 但是由於才疏學淺
: : 故來此詢問各位先進和專家, 這類型的服務是否有前景呢?
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 172.245.16.16
1F：推 puec2:我還沒看過沒有做過動物實驗的藥有藥廠會買的。 11/21 11:44
2F：→ puec2:如果你們可以在不增加細胞或動物實驗的成本的前提之下， 11/21 11:44
3F：→ puec2:利用modeling找出有效的小分子，這樣就有獲利的機會啦。 11/21 11:45
4F：推 Marriott:但我覺得要想想,你要用的是套裝軟體,用的database也不外 11/21 13:49
5F：→ Marriott:乎是MDL,NCI,SPEC等等常用的,你的target要有市場的話大 11/21 13:52
6F：→ Marriott:概也不會是什麼冷門的標的,我是不覺得藥廠是完全沒作過 11/21 13:54
7F：→ puec2:我倒不會這樣想，我預設他們有特殊的方法可以看到別人沒看過 11/21 13:59
8F：→ puec2:的東西。但是如果只是買設備和軟體回來想做modeling代工... 11/21 13:59
9F：→ puec2:或許對一些國內的小藥廠甚至大學裡面需要多一個DATA用來增加 11/21 14:00
10F：→ puec2:paper內容的實驗室會比較有吸引力。 11/21 14:01
11F：→ puec2:做一次modeling收個5萬，給出10幾種compound讓研究生去try 11/21 14:02
12F：→ puec2:只要看到效果就好，micromole級的EC50也不在乎 XD 11/21 14:02
13F：推 motorbird:Amgen一個計畫他們的computing candidate有上千個 真的 11/21 14:03
14F：→ puec2:*micromolar 11/21 14:03
15F：→ motorbird:到了in vivo可能再narrow down到30個 為什麼有這種差異 11/21 14:04
16F：→ motorbird:就是因為無法預測毒性 安定性 溶解度等等的問題 11/21 14:05
17F：→ motorbird:如果你們的系統準確率很高 連這些都可以做預測 11/21 14:05
18F：→ motorbird:那價值才有辦法做出來 不然花大錢組個團隊後面效益可能 11/21 14:05
19F：→ motorbird:不高 需要好好考慮... 11/21 14:05
20F：推 Marriott:PK,ADMET等等的問題太多了,真能找到一個lead還真是難阿 11/21 14:06
21F：推 puec2:溶解度有的時候是要看是誰在做 XD 11/21 14:07
22F：推 motorbird:只是其一嘛 XD 模擬跟實際在目前來說差異還是很大 11/21 14:08
24F：→ puec2:給您參考 11/21 14:09
25F：→ piimaila:基本上毒性 溶解度等等倒不是問題~雖然不太好說 11/21 16:06
26F：→ piimaila:但是 基本上能出來的資料除了驗證效果外. 無毒, 可吸收 11/21 16:06
27F：→ piimaila:倒是可以保證 11/21 16:06
28F：→ piimaila:當然啦, 我指的是普通人不是問題, 病人就...不太確定 11/21 16:07
29F：→ piimaila:簡單的說, 就是利用傳統食品內純化的東西下去做預測 11/21 16:08
30F：→ piimaila:並簡單的計算劑量和藥物預測這樣 11/21 16:08
31F：→ piimaila:當然啦, 我是搞電腦的, 其他的東西我不太懂@@ 11/21 16:09
32F：→ piimaila:我這裡只是處理高速運算. 生技問題我不太想讓我的合夥人 11/21 16:09
33F：→ piimaila:知道我在非常猶豫(當然他不上ptt 不看中文..所以才來這問 11/21 16:10
34F：→ piimaila:)^^~~ 11/21 16:10
35F：→ puec2:其實你如果可以提供他們的paper 大家就可以告訴你他是有 11/21 16:39
36F：→ puec2:獨門技術還是靠套裝軟體砸出來的 11/21 16:39
37F：→ piimaila:我去問問... 11/21 16:58
38F：→ skyyo:上次聽有人講所謂生技創投金主就是3F Friend Family Fool 11/21 20:29
39F：→ skyyo:建議當做買bit幣差不多 買了就放著 放著就忘了吧 11/21 20:30
40F：→ piimaila:bit幣~漲翻了大哥 11/21 21:23
41F：→ piimaila:我有陣子也在玩 小賺一點, 但現在摸都不能摸 11/21 21:23
42F：→ piimaila:還有 事實上我投入不太多, 只是改程式和架設高速Server 11/21 21:24
43F：→ piimaila:出一點k20而已 bit幣時代殘存的雜物 拿來用用這樣 11/21 21:25
44F：→ piimaila:而且 我是覺得他們的東西 基本上可行 可行的原因 11/21 21:27
45F：→ piimaila:是根本不是新藥 只是新應用而已 11/21 21:27
46F：→ piimaila:簡單的說 治療一些奇怪病症的藥 根本早就有 11/21 21:28
47F：→ piimaila:只是沒人拿來治療那些病症 當然 我只說電腦預測可以 11/21 21:29
48F：→ piimaila:實際上是未知的... 11/21 21:29
49F：推 skyyo:我是說請把這次投資當作跟bit幣同等風險的等級 11/23 16:51
50F：→ skyyo:bit幣是有漲沒錯 但不代表同等風險的都一定會成功 11/23 16:51