作者piimaila (肥仔)
看板Bioindustry
标题Re: [问题] 电脑模拟蛋白质制药的需求?
时间Thu Nov 21 11:35:10 2013
稍微整理一下目前讨论结果
如果想要厂商接受
电脑实现高通量筛选要可行必须有
1. 配体(化合物, 药物)够多, 也就是目标应该定在 缩小传统HT的范围.
2. 由於目标是1 所以速度必须远高於厂商能够取得的HT机器之速度.
3. 由於是缩小传统HT的范围故价格要低於缩小HT范围所得到的价格效益
但是, 如果另一方向想,
如果 能找到一个各方人才的团队(主要是生技, 资讯人员)
开发出目前市面上疑难杂症的药物, 该症目前可能宣称为不治之症或慢性病
当然, 不可能是治癒, 但是理论上可以控制.
举例说明: 红斑性狼疮, 第二型糖尿病, 痰湿型肥胖症
该药物群"仅"通过电脑筛选. 这样, 这些资料是否有市场呢?
※ 引述《s122s91 (lo)》之铭言：
: 如果你用现在上市的药,
: 用电脑模拟去算,分数一定不是最高的
: 如果把电脑设定成"上市药物"为最高分的参数,拿来跑,设计出来的药物,活性通常不高
: 我想这就是困境。
: 不知道到现在为止,有没有药物是真的由模拟出来的。
: 电脑模拟就是模拟,不一定准。
: ※ 引述《piimaila (肥仔)》之铭言：
: : 想请问, 蛋白质制药预测的整体解决方案
: : 例如:
: : 利用电脑软体预估 以下课题
: : 多醣体抑制癌症能力(中研院)
: : 这种是否有实用性和市场?
: : 或市面上已经有类似厂商?
: : 当然, 这只是预测, 不可取代人体实验 动物实验等
: : 但可以大量的减少实验范围.
: : 弊人想投资类似公司, 但是由於才疏学浅
: : 故来此询问各位先进和专家, 这类型的服务是否有前景呢?
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 172.245.16.16
1F：推 puec2:我还没看过没有做过动物实验的药有药厂会买的。 11/21 11:44
2F：→ puec2:如果你们可以在不增加细胞或动物实验的成本的前提之下， 11/21 11:44
3F：→ puec2:利用modeling找出有效的小分子，这样就有获利的机会啦。 11/21 11:45
4F：推 Marriott:但我觉得要想想,你要用的是套装软体,用的database也不外 11/21 13:49
5F：→ Marriott:乎是MDL,NCI,SPEC等等常用的,你的target要有市场的话大 11/21 13:52
6F：→ Marriott:概也不会是什麽冷门的标的,我是不觉得药厂是完全没作过 11/21 13:54
7F：→ puec2:我倒不会这样想，我预设他们有特殊的方法可以看到别人没看过 11/21 13:59
8F：→ puec2:的东西。但是如果只是买设备和软体回来想做modeling代工... 11/21 13:59
9F：→ puec2:或许对一些国内的小药厂甚至大学里面需要多一个DATA用来增加 11/21 14:00
10F：→ puec2:paper内容的实验室会比较有吸引力。 11/21 14:01
11F：→ puec2:做一次modeling收个5万，给出10几种compound让研究生去try 11/21 14:02
12F：→ puec2:只要看到效果就好，micromole级的EC50也不在乎 XD 11/21 14:02
13F：推 motorbird:Amgen一个计画他们的computing candidate有上千个 真的 11/21 14:03
14F：→ puec2:*micromolar 11/21 14:03
15F：→ motorbird:到了in vivo可能再narrow down到30个 为什麽有这种差异 11/21 14:04
16F：→ motorbird:就是因为无法预测毒性 安定性 溶解度等等的问题 11/21 14:05
17F：→ motorbird:如果你们的系统准确率很高 连这些都可以做预测 11/21 14:05
18F：→ motorbird:那价值才有办法做出来 不然花大钱组个团队後面效益可能 11/21 14:05
19F：→ motorbird:不高 需要好好考虑... 11/21 14:05
20F：推 Marriott:PK,ADMET等等的问题太多了,真能找到一个lead还真是难阿 11/21 14:06
21F：推 puec2:溶解度有的时候是要看是谁在做 XD 11/21 14:07
22F：推 motorbird:只是其一嘛 XD 模拟跟实际在目前来说差异还是很大 11/21 14:08
24F：→ puec2:给您参考 11/21 14:09
25F：→ piimaila:基本上毒性 溶解度等等倒不是问题~虽然不太好说 11/21 16:06
26F：→ piimaila:但是 基本上能出来的资料除了验证效果外. 无毒, 可吸收 11/21 16:06
27F：→ piimaila:倒是可以保证 11/21 16:06
28F：→ piimaila:当然啦, 我指的是普通人不是问题, 病人就...不太确定 11/21 16:07
29F：→ piimaila:简单的说, 就是利用传统食品内纯化的东西下去做预测 11/21 16:08
30F：→ piimaila:并简单的计算剂量和药物预测这样 11/21 16:08
31F：→ piimaila:当然啦, 我是搞电脑的, 其他的东西我不太懂@@ 11/21 16:09
32F：→ piimaila:我这里只是处理高速运算. 生技问题我不太想让我的合夥人 11/21 16:09
33F：→ piimaila:知道我在非常犹豫(当然他不上ptt 不看中文..所以才来这问 11/21 16:10
34F：→ piimaila:)^^~~ 11/21 16:10
35F：→ puec2:其实你如果可以提供他们的paper 大家就可以告诉你他是有 11/21 16:39
36F：→ puec2:独门技术还是靠套装软体砸出来的 11/21 16:39
37F：→ piimaila:我去问问... 11/21 16:58
38F：→ skyyo:上次听有人讲所谓生技创投金主就是3F Friend Family Fool 11/21 20:29
39F：→ skyyo:建议当做买bit币差不多 买了就放着 放着就忘了吧 11/21 20:30
40F：→ piimaila:bit币~涨翻了大哥 11/21 21:23
41F：→ piimaila:我有阵子也在玩 小赚一点, 但现在摸都不能摸 11/21 21:23
42F：→ piimaila:还有 事实上我投入不太多, 只是改程式和架设高速Server 11/21 21:24
43F：→ piimaila:出一点k20而已 bit币时代残存的杂物 拿来用用这样 11/21 21:25
44F：→ piimaila:而且 我是觉得他们的东西 基本上可行 可行的原因 11/21 21:27
45F：→ piimaila:是根本不是新药 只是新应用而已 11/21 21:27
46F：→ piimaila:简单的说 治疗一些奇怪病症的药 根本早就有 11/21 21:28
47F：→ piimaila:只是没人拿来治疗那些病症 当然 我只说电脑预测可以 11/21 21:29
48F：→ piimaila:实际上是未知的... 11/21 21:29
49F：推 skyyo:我是说请把这次投资当作跟bit币同等风险的等级 11/23 16:51
50F：→ skyyo:bit币是有涨没错 但不代表同等风险的都一定会成功 11/23 16:51