※ 引述《hajimels (阿一)》之銘言： : ※ 引述《liuse (充實自己，提昇自己)》之銘言： : 你這裡是在指什麼? P-value? FDR? : 如果是指p-value, FDR 沒有設多少的問題 那就是只是機率 我這邊指的是RNAseq拼貼時找不到序列的時候 數值為0 但我的軟體不接受0這個數字 所以不是機率 而是最低值 或者說是接受被納入計算的最小值是多少? : 你了解sequencing嗎? 表現量有很多表示方法 RPKM/FPKM, Raw counts等等 : 有沒有特殊意義 當然有..... : 這問題是要針對你的實驗來討論 : 分析數據那些threshold都是活的 : 而且fold-change只是一部分,本身read counts也很重要 : 以你例子來說 : A transcripts: 100 read counts -> 5,000 read counts : B transcripts: 10,000 read counts -> 500,000 read counts : 同樣是50倍 在生物上意義是不同的 : 解釋數據全看你生物功力, 只能多念書了 我這邊表現量是使用FPKM目前還在努力看懂這部分的東西 書念得還不夠多....感謝了 -- 很囧 我想睡覺 --

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