※ 引述《hajimels (阿一)》之铭言： : ※ 引述《liuse (充实自己，提昇自己)》之铭言： : 你这里是在指什麽? P-value? FDR? : 如果是指p-value, FDR 没有设多少的问题 那就是只是机率 我这边指的是RNAseq拼贴时找不到序列的时候 数值为0 但我的软体不接受0这个数字 所以不是机率 而是最低值 或者说是接受被纳入计算的最小值是多少? : 你了解sequencing吗? 表现量有很多表示方法 RPKM/FPKM, Raw counts等等 : 有没有特殊意义 当然有..... : 这问题是要针对你的实验来讨论 : 分析数据那些threshold都是活的 : 而且fold-change只是一部分,本身read counts也很重要 : 以你例子来说 : A transcripts: 100 read counts -> 5,000 read counts : B transcripts: 10,000 read counts -> 500,000 read counts : 同样是50倍 在生物上意义是不同的 : 解释数据全看你生物功力, 只能多念书了 我这边表现量是使用FPKM目前还在努力看懂这部分的东西 书念得还不够多....感谢了 -- 很囧 我想睡觉 --

※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 140.109.236.130 ※ 文章网址: http://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/BioMedInfo/M.1412656153.A.4FF.html