作者lingon (林果)
看板BioMedInfo
標題來玩玩真的問題好了(原Re: [公告] 新增版規第二條)
時間Fri Apr 6 21:08:13 2012
我先拋磚引玉先丟個實際遇到的問題讓大家討論看看
要不然整天只剩上世紀的問題跟要paper 也不是辦法
今天我有十對Tumor/Normal sample pair for cancer X, fresh tissue
已經製造了如下:
1. 兩對 full genome sequence
2. 一對 (Tumor/Normal) RNASeq transcriptome
3. 三對 full genome Methylation array
4. 兩對 mRNA array
目前除了做CNV detection, Differential expression 等較平常的分析外
還開始看RNA editing, 除此之外, 不曉得大家有什麼其他可以切入的角度
來分析這份資料?
※ 引述《hajimels (阿一)》之銘言：
: 其實這邊反應著台灣做研究的人對於生資這個領域的態度
: 生資 = Array.new
: 生資[0] = "blast"
: 生資[1] = "ncbi找sequence"
: 生資[2] = "電腦"
: 生資[3] = "???"
: 生資.each do |ability|
: print "我有一個同學在做生資的,他應該會"+ ability
: end
: 以上.....
: ※ 引述《huggie (huggie)》之銘言：
: : 大家好
: : 新增版規第二條，徵求 paper 的文章請在七天內自行刪除。
: : 沒刪除的話，我看到會幫刪 (不會給劣文)。
: : 如果刪除後仍有需要，請麻煩再貼文囉。
: : 從明日起開始實施，對這條版規有意見的話請發表
: : (應該沒有人會有吧?! :p ) 謝謝。
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 155.52.120.143
※ 編輯: lingon 來自: 155.52.120.143 (04/07 06:01)
1F：→ gsuper:刷SNP的case-control study , 但樣本數太小 04/09 18:54
2F：→ gsuper:NGS 能組出 [miRNA] 的資料嗎? 04/09 18:55
3F：推 hajimels:Rseq若是用poly A enrichment的話，頂多看到precursor 04/09 22:47
4F：→ hajimels:用Ribominus才有機會吧 但是又要扯到abundance的問題了。 04/09 22:48
※ 編輯: lingon 來自: 155.52.120.143 (04/09 23:39)