作者lingon (林果)
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标题来玩玩真的问题好了(原Re: [公告] 新增版规第二条)
时间Fri Apr 6 21:08:13 2012
我先抛砖引玉先丢个实际遇到的问题让大家讨论看看
要不然整天只剩上世纪的问题跟要paper 也不是办法
今天我有十对Tumor/Normal sample pair for cancer X, fresh tissue
已经制造了如下:
1. 两对 full genome sequence
2. 一对 (Tumor/Normal) RNASeq transcriptome
3. 三对 full genome Methylation array
4. 两对 mRNA array
目前除了做CNV detection, Differential expression 等较平常的分析外
还开始看RNA editing, 除此之外, 不晓得大家有什麽其他可以切入的角度
来分析这份资料?
※ 引述《hajimels (阿一)》之铭言：
: 其实这边反应着台湾做研究的人对於生资这个领域的态度
: 生资 = Array.new
: 生资[0] = "blast"
: 生资[1] = "ncbi找sequence"
: 生资[2] = "电脑"
: 生资[3] = "???"
: 生资.each do |ability|
: print "我有一个同学在做生资的,他应该会"+ ability
: end
: 以上.....
: ※ 引述《huggie (huggie)》之铭言：
: : 大家好
: : 新增版规第二条，徵求 paper 的文章请在七天内自行删除。
: : 没删除的话，我看到会帮删 (不会给劣文)。
: : 如果删除後仍有需要，请麻烦再贴文罗。
: : 从明日起开始实施，对这条版规有意见的话请发表
: : (应该没有人会有吧?! :p ) 谢谢。
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 155.52.120.143
※ 编辑: lingon 来自: 155.52.120.143 (04/07 06:01)
1F：→ gsuper:刷SNP的case-control study , 但样本数太小 04/09 18:54
2F：→ gsuper:NGS 能组出 [miRNA] 的资料吗? 04/09 18:55
3F：推 hajimels:Rseq若是用poly A enrichment的话，顶多看到precursor 04/09 22:47
4F：→ hajimels:用Ribominus才有机会吧 但是又要扯到abundance的问题了。 04/09 22:48
※ 编辑: lingon 来自: 155.52.120.143 (04/09 23:39)