作者hermeslu (左慈)
看板BioMedInfo
標題[討論] Next Generation Sequencing and Microarray
時間Sat Jan 9 08:21:10 2010
最近在看NGS (next generation sequencing) 的一些網站，
其中一個中文網站認為
NGS可以取代Microarray，
這就是我不懂之處，
Microaray 是幫助我們了解 gene expression
在不同樣本間比較 (比如有病 VS 健康)
NGS是分析genomic at sequence-base
兩種方法對我而言目的不同，
如何討論"取代"
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 115.64.9.214
1F：推 qqSmallFrog:People can use NGS to sequence cDNA or mRNA. 01/09 12:12
2F：→ qqSmallFrog:By mapping the sequence reads to reference genome, 01/09 12:13
3F：→ qqSmallFrog:we can directly count the number of reads from 01/09 12:14
4F：→ qqSmallFrog:each gene. I personally prefer this over micro- 01/09 12:14
5F：→ qqSmallFrog:array, which only compares the fluorescence, 01/09 12:15
6F：→ qqSmallFrog:leaving rooms for error. (Although I haven't done 01/09 12:16
7F：→ qqSmallFrog:either of them yet.) 01/09 12:16
8F：推 wjho:如樓上 可以去查一些 RNA-seq 的 review paper 看看 01/10 00:23
9F：推 leondemon:去思考一下NGS如何產生data 以及它的量和品質就可以知道 01/10 11:58
10F：推 jademan:Nat Rev Microbiol. 2009 Apr;7(4):287-96. 參考一下 01/12 14:56
11F：推 leftt:是可以取代，但是NGS價格實在太貴了... 01/28 00:28