作者hermeslu (左慈)
看板BioMedInfo
标题[讨论] Next Generation Sequencing and Microarray
时间Sat Jan 9 08:21:10 2010
最近在看NGS (next generation sequencing) 的一些网站，
其中一个中文网站认为
NGS可以取代Microarray，
这就是我不懂之处，
Microaray 是帮助我们了解 gene expression
在不同样本间比较 (比如有病 VS 健康)
NGS是分析genomic at sequence-base
两种方法对我而言目的不同，
如何讨论"取代"
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 115.64.9.214
1F：推 qqSmallFrog:People can use NGS to sequence cDNA or mRNA. 01/09 12:12
2F：→ qqSmallFrog:By mapping the sequence reads to reference genome, 01/09 12:13
3F：→ qqSmallFrog:we can directly count the number of reads from 01/09 12:14
4F：→ qqSmallFrog:each gene. I personally prefer this over micro- 01/09 12:14
5F：→ qqSmallFrog:array, which only compares the fluorescence, 01/09 12:15
6F：→ qqSmallFrog:leaving rooms for error. (Although I haven't done 01/09 12:16
7F：→ qqSmallFrog:either of them yet.) 01/09 12:16
8F：推 wjho:如楼上 可以去查一些 RNA-seq 的 review paper 看看 01/10 00:23
9F：推 leondemon:去思考一下NGS如何产生data 以及它的量和品质就可以知道 01/10 11:58
10F：推 jademan:Nat Rev Microbiol. 2009 Apr;7(4):287-96. 参考一下 01/12 14:56
11F：推 leftt:是可以取代，但是NGS价格实在太贵了... 01/28 00:28