作者e80814 (能唸完研究所嗎?哭哭)
看板BioMedInfo
標題[問題]預測設計的ligand是否會和receptor結合
時間Wed Dec 30 18:00:50 2009
各位學長姐好
我目前遇到的問題是
我希望設計出一段約10 amino acid的ligand
去和receptor結合後抑制他和正常ligand的結合
因此我上網去找預測docking的軟體去預測分析
我嘗試用autodock軟體
可是用了好久都不懂要如何操作autodock軟體
所以想請問各位學長姐
是否有其他預測軟體或線上分析網站可以使用
希望能好操作一點
來預測ligand和receptor間的docking
p.s.小碩一生剛踏入生資領域 如果問了笨問題請大家多多指教
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.117.39.167
1F：推 cloudcc:AUTODOCK好像只能用在PROTEIN跟小分子的結合 12/30 19:31
2F：→ cloudcc:十個AA分子量應該破千了吧,而且也不夠RIGID,看看有沒有專 12/30 19:32
3F：→ cloudcc:門做這類DOCKING的軟體吧 12/30 19:33
4F：推 fishcan90177:Dock,GOLD,Flex,AMBER,CHARMM? 01/05 10:45