作者e80814 (能念完研究所吗?哭哭)
看板BioMedInfo
标题[问题]预测设计的ligand是否会和receptor结合
时间Wed Dec 30 18:00:50 2009
各位学长姐好
我目前遇到的问题是
我希望设计出一段约10 amino acid的ligand
去和receptor结合後抑制他和正常ligand的结合
因此我上网去找预测docking的软体去预测分析
我尝试用autodock软体
可是用了好久都不懂要如何操作autodock软体
所以想请问各位学长姐
是否有其他预测软体或线上分析网站可以使用
希望能好操作一点
来预测ligand和receptor间的docking
p.s.小硕一生刚踏入生资领域 如果问了笨问题请大家多多指教
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.117.39.167
1F：推 cloudcc:AUTODOCK好像只能用在PROTEIN跟小分子的结合 12/30 19:31
2F：→ cloudcc:十个AA分子量应该破千了吧,而且也不够RIGID,看看有没有专 12/30 19:32
3F：→ cloudcc:门做这类DOCKING的软体吧 12/30 19:33
4F：推 fishcan90177:Dock,GOLD,Flex,AMBER,CHARMM? 01/05 10:45