作者MVP168JAMS (拔刀)
看板BioMedInfo
標題[問題] 想請問版上要如何得知RNA 2級結構
時間Thu Jul 23 16:29:02 2009
我已經有使用網路上MFOLD的預測網業了
結果出來了約20個結構圖
那我本身是使用病毒的IRES去做
但是我一直不知道要如何接下去
才能和PAPER一樣可以有一圖檔包含了2級結果的DOMAIN
並且可以進一步知道是序列幾到序列幾是一個DOMAIN
再麻煩請各位版上大大告知
謝謝
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.129.77.129
1F：→ windincloud:你可以給個例子嘛? 我不太能了解你想要怎樣的DOMAIN~ 07/23 21:58
2F：→ windincloud:基本上mfold跑出來就會有跑出pdf檔 讓你可以看出 07/23 21:59
3F：→ windincloud:folding後的樣子及rnafold檔說明binding的結果 07/23 22:00
4F：→ MVP168JAMS:我現在是拿病毒的IRES序列去分析 07/24 11:57
5F：→ MVP168JAMS:使用Mfold的線上網頁預測出有20個圖 07/24 11:59
6F：→ MVP168JAMS:那我現在是希望可以做出像HCV相關PAPER的IRES 2級的圖 07/24 12:00
7F：→ MVP168JAMS:我現在的問題是我不知道要怎麼從這20個圖在往下進行 07/24 12:01
8F：→ MVP168JAMS:就是有確定的圖 不好意思再麻煩你一下 拍謝 07/24 12:03
9F：→ MVP168JAMS:因為我本身第一次嘗試 很多地方我都說不清 抱歉 07/24 12:07
10F：→ MVP168JAMS:不好意思我不會回水球 我可以直接把PAPER PO在這嗎 07/24 15:18