作者MVP168JAMS (拔刀)
看板BioMedInfo
标题[问题] 想请问版上要如何得知RNA 2级结构
时间Thu Jul 23 16:29:02 2009
我已经有使用网路上MFOLD的预测网业了
结果出来了约20个结构图
那我本身是使用病毒的IRES去做
但是我一直不知道要如何接下去
才能和PAPER一样可以有一图档包含了2级结果的DOMAIN
并且可以进一步知道是序列几到序列几是一个DOMAIN
再麻烦请各位版上大大告知
谢谢
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.129.77.129
1F：→ windincloud:你可以给个例子嘛? 我不太能了解你想要怎样的DOMAIN~ 07/23 21:58
2F：→ windincloud:基本上mfold跑出来就会有跑出pdf档 让你可以看出 07/23 21:59
3F：→ windincloud:folding後的样子及rnafold档说明binding的结果 07/23 22:00
4F：→ MVP168JAMS:我现在是拿病毒的IRES序列去分析 07/24 11:57
5F：→ MVP168JAMS:使用Mfold的线上网页预测出有20个图 07/24 11:59
6F：→ MVP168JAMS:那我现在是希望可以做出像HCV相关PAPER的IRES 2级的图 07/24 12:00
7F：→ MVP168JAMS:我现在的问题是我不知道要怎麽从这20个图在往下进行 07/24 12:01
8F：→ MVP168JAMS:就是有确定的图 不好意思再麻烦你一下 拍谢 07/24 12:03
9F：→ MVP168JAMS:因为我本身第一次尝试 很多地方我都说不清 抱歉 07/24 12:07
10F：→ MVP168JAMS:不好意思我不会回水球 我可以直接把PAPER PO在这吗 07/24 15:18