作者hermeslu (左慈)
看板BioMedInfo
標題[程式] 使用R cluster 處理microarray資料
時間Thu Feb 12 06:44:21 2009
想問大家一個問題，
我的狀況是資料比數太大，
使用hclust，將資料as.dendrogram，再str看結果，
可是資料太大即使捲軸在最高，
分群結果還是無法從頭開始。
plot更慘，完全擠在一起，根本看不出結果。
圖片
http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/756.page
想問版友：
1. 有沒有指令可以將分群結果輸出成 .txt ？
2. 或者其他分群package有包含可將分群結果輸出的指令？
重點就是 我該如何得到分群結果。
先謝謝大家，等待好消息
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 149.171.224.229
1F：推 auymle:你要不要用cluster 3.0搭配Java TreeView來做 02/12 16:52
2F：→ auymle:或是用GAP等clustering的軟體來做 02/12 16:52
3F：→ auymle:至少這些工具visulization的部分比較好 02/12 16:55
4F：推 hajimels:樓上提到的 有整合在MeV裡 個人覺得還不錯用 02/13 10:43
5F：→ hermeslu:謝謝 我試試cluster3.0 什麼是MeV 02/13 17:02
6F：→ hajimels:google key word: MeV <--第一筆就是了 02/13 18:51
7F：→ hermeslu:MeV太讚 真是好用 謝謝樓上所有人 02/17 15:04