作者hermeslu (左慈)
看板BioMedInfo
标题[程式] 使用R cluster 处理microarray资料
时间Thu Feb 12 06:44:21 2009
想问大家一个问题,
我的状况是资料比数太大,
使用hclust,将资料as.dendrogram,再str看结果,
可是资料太大即使卷轴在最高,
分群结果还是无法从头开始。
plot更惨,完全挤在一起,根本看不出结果。
图片
http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/756.page
想问版友:
1. 有没有指令可以将分群结果输出成 .txt ?
2. 或者其他分群package有包含可将分群结果输出的指令?
重点就是 我该如何得到分群结果。
先谢谢大家,等待好消息
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 149.171.224.229
1F:推 auymle:你要不要用cluster 3.0搭配Java TreeView来做 02/12 16:52
2F:→ auymle:或是用GAP等clustering的软体来做 02/12 16:52
3F:→ auymle:至少这些工具visulization的部分比较好 02/12 16:55
4F:推 hajimels:楼上提到的 有整合在MeV里 个人觉得还不错用 02/13 10:43
5F:→ hermeslu:谢谢 我试试cluster3.0 什麽是MeV 02/13 17:02
6F:→ hajimels:google key word: MeV <--第一笔就是了 02/13 18:51
7F:→ hermeslu:MeV太赞 真是好用 谢谢楼上所有人 02/17 15:04