作者jasperlin (妳的微笑)
看板BioMedInfo
標題[問題] Gene Ontology分析軟體
時間Fri Oct 17 11:08:08 2008
各位前輩....
小的目前從事蛋白質體的實驗，利用質譜對菌株進行蛋白質修飾的研究
現在得到大量的protein ID,想對這些不同的蛋白做Gnen Ontology的分析
我現在想用Blast2GO、BiNGO Cytoscape plugin做分析
但對這類軟體使用方式完全不懂，研讀過一些相關的說明
但仍摸不著頭緒
不知道各位前輩有沒有使用過這一類的軟體，可以給小的一些指點，謝謝
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如果時間可以停留的話
就讓我永遠留在你身邊吧！
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◆ From: 140.109.65.236
1F：推 huggie:我只有稍微玩過中研院的 GOBU，堪用，但不是非常的好用 10/17 13:01
2F：推 huggie:input檔案如果有錯也不會提醒..繼續run下去結果就會很奇怪 10/17 13:02
3F：推 hajimels:除了GO外還有想做PPI嘛?不然並不需要你說的工具便可分析 10/17 21:22
4F：→ hajimels:biomart->IPI轉HGNC Symbol->DAVID 就好了 10/17 21:23
5F：→ hajimels:IPI轉GeneSymobl也可以直接download IPI的xref 10/17 21:24
6F：→ hajimels:用M$ Excel的vlookup便可以自行對映 10/17 21:24