作者jasperlin (你的微笑)
看板BioMedInfo
标题[问题] Gene Ontology分析软体
时间Fri Oct 17 11:08:08 2008
各位前辈....
小的目前从事蛋白质体的实验，利用质谱对菌株进行蛋白质修饰的研究
现在得到大量的protein ID,想对这些不同的蛋白做Gnen Ontology的分析
我现在想用Blast2GO、BiNGO Cytoscape plugin做分析
但对这类软体使用方式完全不懂，研读过一些相关的说明
但仍摸不着头绪
不知道各位前辈有没有使用过这一类的软体，可以给小的一些指点，谢谢
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如果时间可以停留的话
就让我永远留在你身边吧！
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.65.236
1F：推 huggie:我只有稍微玩过中研院的 GOBU，堪用，但不是非常的好用 10/17 13:01
2F：推 huggie:input档案如果有错也不会提醒..继续run下去结果就会很奇怪 10/17 13:02
3F：推 hajimels:除了GO外还有想做PPI嘛?不然并不需要你说的工具便可分析 10/17 21:22
4F：→ hajimels:biomart->IPI转HGNC Symbol->DAVID 就好了 10/17 21:23
5F：→ hajimels:IPI转GeneSymobl也可以直接download IPI的xref 10/17 21:24
6F：→ hajimels:用M$ Excel的vlookup便可以自行对映 10/17 21:24