※ 引述《HIbaby (燃燒吧! 嗨~北鼻!)》之銘言： : 最近手邊多了很多大量microarry data. 不外乎就是很多基因的ID碼 : 或是一些基因的縮寫. : 不知道有沒有一些小軟體, 可以把excel上面這些ID直接連結到資料庫 : 或是轉換成全名? : 如果有這樣的東西, 那就非常方便了 同是生物背景的 想很害羞得自己推一下我們家的產品 因為我也懶得寫程式XD Arrayfusion( http://microarray.ym.edu.tw/tools/arrayfusion/ ) 這是用JSP寫成的web application 目前的功能包括將affy的probeset改寫成EGR/GFF的格式 或是把Gene Symbols轉換成Affy U133 plus2的probesets 或是將Gene Symbols mapping到genome位置上 所以如果Hibaby老大的資料是用Gene Symbol/ Ensembl ID/ GenBank RefSeq 為主 不妨可以試用看看 使用方法很簡單 先選擇平台 (agilent跟affy的expression/Exon/Tilling/SNP array皆可，若是要用上列的ID 則要選public domain ID) 然後選擇ID的種類 (array: U133 plus2, U95 etc; GeneID: gene symbol,genbank,Refseq, etc) 指定所要的output種類 (純文字 and/or EGR and/or GFF) 最後上傳檔案或是直接貼上文字 (將每一個ID存成一行) 然後按下submit就好囉 不需要擔心資料外洩 因為使用者上傳的資料都是存在session之中 我們自己的database只負責用作mapping 大致上是這樣，想看paper的話可以參考 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16935928 如果有前輩後進願意抽空一試的話，也歡迎給予批評指教囉 謝謝 --

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