作者HIbaby (燃燒吧! 嗨~北鼻!)
看板BioMedInfo
標題[討論] 小程式
時間Tue Jun 17 12:22:45 2008
最近手邊多了很多大量microarry data. 不外乎就是很多基因的ID碼
或是一些基因的縮寫.
不知道有沒有一些小軟體, 可以把excel上面這些ID直接連結到資料庫
或是轉換成全名?
如果有這樣的東西, 那就非常方便了
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◆ From: 133.11.70.111
1F：→ windincloud:excel的話 應該可以寫VB script去達成你的要求 或是你 06/17 13:07
2F：→ windincloud:先將其另存成csv檔後 自行用perl或php python去抓囉~ 06/17 13:09
3F：推 masamonster:轉換資料可以參考ftp://ftp.ncbi.nih.gov/gene/DATA/ 06/17 13:31
4F：→ masamonster:內的GENE_INFO 有ID SYMBOL DESCRIPTION 等資訊 06/17 13:31
5F：推 huggie:有mesamonster提供的這個.我倒是有個粗糙的程式可以把它跟 06/17 16:55
6F：推 huggie:你 excel 存成 tab delimited file 之後的東西join在一起 06/17 16:55
7F：推 hajimels:如果你會perl->Ensembl API + SpreadSheet(from CPAN) 06/17 22:21
8F：→ hajimels:可以google一下 documents也寫很清楚 06/17 22:22
9F：→ HIbaby:謝謝... 我研究看看^^ 06/18 12:53
10F：推 hajimels:如果真的不會 我可以貼我的code含註解給你看 很easy的 06/18 14:10
11F：→ HIbaby:^^ 樓上是好人 06/18 15:59
12F：推 huggie:Hibaby對程式有研究嗎? 06/18 16:44
13F：→ HIbaby:目前沒有^^ 素人一個, 不過有興趣接觸. 可能要過一陣子^^ 06/19 07:28
14F：→ hajimels:我最近比較忙一點 我註解好再貼上來吧... 06/19 12:26
15F：→ hajimels:我的code不寫註解... 你會看到吐白沫=.= 06/19 12:27
16F：→ hajimels:我是那種寫程式 過個一陣沒去改 就會忘記自己寫啥的人XD 06/19 12:28