作者HIbaby (燃烧吧! 嗨~北鼻!)
看板BioMedInfo
标题[讨论] 小程式
时间Tue Jun 17 12:22:45 2008
最近手边多了很多大量microarry data. 不外乎就是很多基因的ID码
或是一些基因的缩写.
不知道有没有一些小软体, 可以把excel上面这些ID直接连结到资料库
或是转换成全名?
如果有这样的东西, 那就非常方便了
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◆ From: 133.11.70.111
1F：→ windincloud:excel的话 应该可以写VB script去达成你的要求 或是你 06/17 13:07
2F：→ windincloud:先将其另存成csv档後 自行用perl或php python去抓罗~ 06/17 13:09
3F：推 masamonster:转换资料可以参考ftp://ftp.ncbi.nih.gov/gene/DATA/ 06/17 13:31
4F：→ masamonster:内的GENE_INFO 有ID SYMBOL DESCRIPTION 等资讯 06/17 13:31
5F：推 huggie:有mesamonster提供的这个.我倒是有个粗糙的程式可以把它跟 06/17 16:55
6F：推 huggie:你 excel 存成 tab delimited file 之後的东西join在一起 06/17 16:55
7F：推 hajimels:如果你会perl->Ensembl API + SpreadSheet(from CPAN) 06/17 22:21
8F：→ hajimels:可以google一下 documents也写很清楚 06/17 22:22
9F：→ HIbaby:谢谢... 我研究看看^^ 06/18 12:53
10F：推 hajimels:如果真的不会 我可以贴我的code含注解给你看 很easy的 06/18 14:10
11F：→ HIbaby:^^ 楼上是好人 06/18 15:59
12F：推 huggie:Hibaby对程式有研究吗? 06/18 16:44
13F：→ HIbaby:目前没有^^ 素人一个, 不过有兴趣接触. 可能要过一阵子^^ 06/19 07:28
14F：→ hajimels:我最近比较忙一点 我注解好再贴上来吧... 06/19 12:26
15F：→ hajimels:我的code不写注解... 你会看到吐白沫=.= 06/19 12:27
16F：→ hajimels:我是那种写程式 过个一阵没去改 就会忘记自己写啥的人XD 06/19 12:28