作者KP454 (時間只是記錄)
看板BioMedInfo
標題Re: [問題] Transcription Start Site
時間Sun Jun 1 22:30:59 2008
這個我幫得上忙
小小回答一下吧!!
首先
先確定你要問的問題
你是要問transcriptional start site 的生物意義 以下簡稱TSS
還是要直接找出這個序列中可能成為TSS的地方
TSS 顧名思義就是在此基因進行轉錄(transcription) 成為RNA的時候
最一開始的地方
也就是真正做出messenger RNA的最一開始的頭
不包含前面一些調控的區域以及RNA Polymerase的結合處
如果是想要找出所有可能的TSS 可以將序列放到open reading frame finder
NCBI 本身也有內含此工具
但請注意
這不是唯一解
有很多種不同的open reading frame finder
名字也不一定是ORF finder
不同的工具建立在不同的理論基礎
所以結果會有所出入喔!!
希望有幫到你囉!!
: 作者: wunshiun (薄荷キャンデー) 看板: Biology
: 標題: [問題] Transcription Start Site
: 時間: Sun Jun 1 22:01:58 2008
: 請問在 http://0rz.tw/cd49U 這條序列當中
: 我想知道CFTR gene的transcriptional start site是指從哪開始呢?
: 我是電資學院的學生 不太懂生物上的名詞
: 希望有人能回答幫助我解除疑惑
: 感謝~~
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有正妹!!! 幹!!跟你說過要先看看你自己的臉...
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◆ From: 140.129.77.166
1F：推 huggie:解釋的不錯，不過我猜他應該是對 Genbank 註解有疑惑 06/01 23:26
2F：→ auymle:ORF的起始位置不代表TSS, 所以ORF是用來預測可能的protein 06/02 09:30
3F：→ auymle:coding region, 而不是用來預測TSS的 06/02 09:30
4F：推 huggie:嗯.對唷~ ^^ 06/02 09:37