作者KP454 (时间只是记录)
看板BioMedInfo
标题Re: [问题] Transcription Start Site
时间Sun Jun 1 22:30:59 2008
这个我帮得上忙
小小回答一下吧!!
首先
先确定你要问的问题
你是要问transcriptional start site 的生物意义 以下简称TSS
还是要直接找出这个序列中可能成为TSS的地方
TSS 顾名思义就是在此基因进行转录(transcription) 成为RNA的时候
最一开始的地方
也就是真正做出messenger RNA的最一开始的头
不包含前面一些调控的区域以及RNA Polymerase的结合处
如果是想要找出所有可能的TSS 可以将序列放到open reading frame finder
NCBI 本身也有内含此工具
但请注意
这不是唯一解
有很多种不同的open reading frame finder
名字也不一定是ORF finder
不同的工具建立在不同的理论基础
所以结果会有所出入喔!!
希望有帮到你罗!!
: 作者: wunshiun (薄荷キャンデー) 看板: Biology
: 标题: [问题] Transcription Start Site
: 时间: Sun Jun 1 22:01:58 2008
: 请问在 http://0rz.tw/cd49U 这条序列当中
: 我想知道CFTR gene的transcriptional start site是指从哪开始呢?
: 我是电资学院的学生 不太懂生物上的名词
: 希望有人能回答帮助我解除疑惑
: 感谢~~
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有正妹!!! 干!!跟你说过要先看看你自己的脸...
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◆ From: 140.129.77.166
1F：推 huggie:解释的不错，不过我猜他应该是对 Genbank 注解有疑惑 06/01 23:26
2F：→ auymle:ORF的起始位置不代表TSS, 所以ORF是用来预测可能的protein 06/02 09:30
3F：→ auymle:coding region, 而不是用来预测TSS的 06/02 09:30
4F：推 huggie:嗯.对唷~ ^^ 06/02 09:37