課程名稱：魚類功能性基因體分析實驗 (3學分) (Laboratory of Functional Genomics Analysis in Fish) 課號：XXXXXX 時間：另訂 地點：臺大漁科館204室或中研院動物所 課程目標：以斑馬魚或吳郭魚為模式動物學習現代功能性基因體研究核心技術，表現 優異之學生並有機會參與國家型基因體研究計畫之進行。 課程負責老師：李士傑老師﹝SJL，台大動物所/生命科學系﹞ 黃鵬鵬老師﹝PPH，中央研究院動物所﹞ 助教群：蕭崇德﹝CDH台大漁科所博士﹞ 林豊益﹝國防生科所博士﹞ 蕭仁傑﹝JCS台大動物所博士﹞ 周銘翊﹝MYC東海生物所碩士﹞ 謝佾娥﹝台大漁科所碩士﹞ 王郁竣﹝台大漁科所碩士﹞ 賴時磊﹝台大漁科所博士生﹞ 朱湘翎﹝台大漁科所碩士生﹞等人 暫定課程： 第一週 專題演講 --魚類功能性基因體學之展望與課程介紹[60 min] SJL/PPH --魚類性別決定及分化之功能性基因分析[30 min] SJL --魚類耳石形成之生理與分子機制[30 min] JCS --魚類鰓與皮膚組織之功能性基因體學[30 min] CDH --利用生物晶片研究魚類之離子與溫度適應[30 min] MYC 第二至第四週 實驗展示 實驗展示內容 --基因選殖、定序、表現等基本分子生物學方法 --cDNA library建立 --質體抽取與基因表現標誌EST的大量定序 --以生物資訊學註解基因表現標誌、 --RT-PCR或定量RT-PCR檢視基因表現標誌的時空表現 --原位雜合(whole-mount in situ hybridization)檢視基因表現標誌的時空表現 --斑馬魚胚基因或其干擾物質顯微注射 --吳郭魚與斑馬魚基因晶片的製作、螢光探針的製備、基因晶片的雜合、基因晶片 的判讀與分析、生物資訊學註解晶片之功能性基因。 第五至第十二週 分組專題研究與實驗 因囿於實驗室空間及助教人數，自本週起學生將自由選取或由授課教師指派至第一 組(四人)李士傑或第二組(八人)黃鵬鵬老師所帶領之研究群(詳見第一週專題演講內 容)進行實驗，基本上每人將在老師及助教之指導下至少完成一個以上基因之分析： 包括基因選殖、定序及胚發育時期基因之時空表現(包括RT-PCR及in situ hybridiza -tion分析)，若實驗及時間許可，學生將可進行魚胚基因或其干擾物質顯微注射之功 能性分析。 第十三週 期末成果報告 將以小型學術研討會方式進行，每位學員有15分鐘的時間報告自己的研究成果，並有 5分鐘的時間進行討論，會中並將邀請數位其他研究單位的老師共同進行成果驗收， 相信完成本核心實驗課程的學員將有能力進行日後基因體功能性分析之相關研究工作。 成績評量 無期中期末測驗，成績評量標準是以上課出席率，實驗成果與期末成果報告(包含口頭 與書面報告)為依據。 修課限制： (1)總人數上限為12人 (2)因名額限制以無研究經驗之大學部學生為優先 (3)因實驗流程之故選課學生須可於正式上課時間外投入相當時間以完成指定實驗計劃 (4)須經授課老師同意始可修習，有興趣者請先與李士傑老師連絡 (Tel: 02-23639291轉109; E-mail:[email protected])。 --

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