课程名称：鱼类功能性基因体分析实验 (3学分) (Laboratory of Functional Genomics Analysis in Fish) 课号：XXXXXX 时间：另订 地点：台大渔科馆204室或中研院动物所 课程目标：以斑马鱼或吴郭鱼为模式动物学习现代功能性基因体研究核心技术，表现 优异之学生并有机会参与国家型基因体研究计画之进行。 课程负责老师：李士杰老师﹝SJL，台大动物所/生命科学系﹞ 黄鹏鹏老师﹝PPH，中央研究院动物所﹞ 助教群：萧崇德﹝CDH台大渔科所博士﹞ 林豊益﹝国防生科所博士﹞ 萧仁杰﹝JCS台大动物所博士﹞ 周铭翊﹝MYC东海生物所硕士﹞ 谢佾娥﹝台大渔科所硕士﹞ 王郁竣﹝台大渔科所硕士﹞ 赖时磊﹝台大渔科所博士生﹞ 朱湘翎﹝台大渔科所硕士生﹞等人 暂定课程： 第一周 专题演讲 --鱼类功能性基因体学之展望与课程介绍[60 min] SJL/PPH --鱼类性别决定及分化之功能性基因分析[30 min] SJL --鱼类耳石形成之生理与分子机制[30 min] JCS --鱼类鳃与皮肤组织之功能性基因体学[30 min] CDH --利用生物晶片研究鱼类之离子与温度适应[30 min] MYC 第二至第四周 实验展示 实验展示内容 --基因选殖、定序、表现等基本分子生物学方法 --cDNA library建立 --质体抽取与基因表现标志EST的大量定序 --以生物资讯学注解基因表现标志、 --RT-PCR或定量RT-PCR检视基因表现标志的时空表现 --原位杂合(whole-mount in situ hybridization)检视基因表现标志的时空表现 --斑马鱼胚基因或其干扰物质显微注射 --吴郭鱼与斑马鱼基因晶片的制作、萤光探针的制备、基因晶片的杂合、基因晶片 的判读与分析、生物资讯学注解晶片之功能性基因。 第五至第十二周 分组专题研究与实验 因囿於实验室空间及助教人数，自本周起学生将自由选取或由授课教师指派至第一 组(四人)李士杰或第二组(八人)黄鹏鹏老师所带领之研究群(详见第一周专题演讲内 容)进行实验，基本上每人将在老师及助教之指导下至少完成一个以上基因之分析： 包括基因选殖、定序及胚发育时期基因之时空表现(包括RT-PCR及in situ hybridiza -tion分析)，若实验及时间许可，学生将可进行鱼胚基因或其干扰物质显微注射之功 能性分析。 第十三周 期末成果报告 将以小型学术研讨会方式进行，每位学员有15分钟的时间报告自己的研究成果，并有 5分钟的时间进行讨论，会中并将邀请数位其他研究单位的老师共同进行成果验收， 相信完成本核心实验课程的学员将有能力进行日後基因体功能性分析之相关研究工作。 成绩评量 无期中期末测验，成绩评量标准是以上课出席率，实验成果与期末成果报告(包含口头 与书面报告)为依据。 修课限制： (1)总人数上限为12人 (2)因名额限制以无研究经验之大学部学生为优先 (3)因实验流程之故选课学生须可於正式上课时间外投入相当时间以完成指定实验计划 (4)须经授课老师同意始可修习，有兴趣者请先与李士杰老师连络 (Tel: 02-23639291转109; E-mail:[email protected])。 --

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