作者Shilia (us, together)
看板AfterPhD
標題Re: [討論] miniPCR: A DNA Discovery System
時間Thu Nov 13 23:50:17 2014
※ 引述《ggg12345 (ggg)》之銘言：
: 謝謝您的說明.
: 這個設備怎麼看, 都看不出要耗$549才能做出來用. 比較先進的地方是那個反覆
: copy 是個有溫度控制的分離, 再製. 特點是可透過手機做程序控制. 最後段是電
: 泳, 螢光標記與分析, 應該也有可能用手機對螢光照相分析才是. 類似的教學用
: 實驗儀器, 台灣應該也可以做出來.
$549 已經比台製 96well 的 PCR 機器便宜很多囉（雖然這 miniPCR 沒到 96well）
那說明看來應該是可透過電腦 (Windows & Mac) 和手機 (iPhone & Android) 做傳
統上是在 PCR machine 上操作的程序設定。所以 miniPCR 不需要內建 Windows 作
業系統也不需要顯示螢幕和觸控面板或鍵盤，純粹就剩下跑 PCR 的 "機器"。
照膠系統也是做成用手機就可以直接拍照存檔（← 我沒看到軟體長怎樣，但我猜應
該沒特別寫個 "分析" 程式，因為一般跑 PCR 就是看有沒有跑出自己想要的 band，
不是拿來做定量用的 ）
$549 這價格，買一台台製的數位照膠系統都還不夠喔！
是說我很久沒問新機的價格了，因為 PCR machine 和數位照膠系統都是種買一次就
可以用很久的東西。
跑 PCR 溫度精確很重要。翻了一下網路上的文件 (
http://goo.gl/gCT9UZ)，這台
應該有辦法做 temperature gradient 去抓 PCR 需要的 annealing temp (比較古
早的 PCR 機器不見得有這功能)。對窮實驗室或窮學校來說，這價格算很實惠啦！
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1F：推 jabari: 三個恆溫水浴槽 + 一個大學供毒生 11/14 00:21
2F：→ jabari: 比起這個 我比較推LAMP的快速診斷 不過得請別人抓條件@@ 11/14 00:22
3F：→ Shilia: 欸我讀文獻時看到 LAMP 也覺得很喜歡。不過台灣有人在用 11/14 13:32
4F：→ Shilia: 這做實驗嗎 (就是 "有沒有口碑客戶的論文可以參考的" ?) 11/14 13:34
5F：→ Shilia: 因為沒有機會用過的東西很難去想說要生出什麼樣的改良版 11/14 13:35
6F：→ Shilia: 三個恆溫水浴槽做 PCR 這件事我真的有試過喔 (我待過一間 11/14 13:37
7F：→ Shilia: 有一大堆古董設備囤積在櫃子裡頭、又只有兩個人在做實驗的 11/14 13:38
8F：→ Shilia: 實驗室。所以有機會嘗試一堆克難又很便宜的方法做實驗) 結 11/14 13:39
9F：→ Shilia: 論是如果本來就比較不好 P 的 PCR，機器都難跑了就不要為 11/14 13:40
10F：→ Shilia: 難大學工讀生了 :P 11/14 13:40
11F：推 jabari: LAMP目前多為碩論...因為主要應用群是鎖定需田野調查的實 11/14 14:35
12F：→ jabari: 驗...不過老師們更多傾向採樣回家作 11/14 14:35
13F：推 ggg12345: 請教一下為甚麼要複製2**32,才能做識別或定序? 11/14 15:01
14F：→ ggg12345: 像交大那個神研究,用啥原理對單基因體做定序?拉直比對? 11/14 15:17
15F：→ Shilia: j大：我相信 "老師們傾向採樣回家做" 這一點，因為基因體 11/14 16:29
16F：→ Shilia: 醫學也會有要收案的研究護理師，他們那也叫 "田野調查" 11/14 16:30
17F：→ Shilia: 抽回來的個案血液檢體是醫生的寶貝，可以用來做很多 GWAS 11/14 16:31
18F：→ Shilia: 還 NGS 分析，如果讓學生在外頭定幾個基因序列定完就算了 11/14 16:32
19F：→ Shilia: 那以後就沒籌碼跟人家談合作研究和掛名啦 11/14 16:33
20F：→ Shilia: g大：我猜您的問題點應該在要跑 PCR 會需要一定量的 DNA。 11/14 16:34
21F：→ Shilia: 現今台灣生醫實驗室最常見的做法是把 PCR 產物送去做 11/14 16:35
23F：→ Shilia: Sanger sequencing 和單細胞基因定序都需要經過 PCR 步驟 11/14 16:38
24F：→ Shilia: 所以有在發展單細胞基因定序技術的人都會知道一個雙套染色 11/14 16:39
25F：→ Shilia: 體的人類細胞大概有 7pg 的染色體 DNA，mRNA 更是少於 1pg 11/14 16:41
26F：→ Shilia: 一定要先放大才足夠現有的定序技術進行 Library 的製備。 11/14 16:42
27F：→ Shilia: 交大那超過物理學極限的神研究就別看了吧，真要發展單細胞 11/14 16:44
28F：→ Shilia: 基因定序技術當然是要從理論和實作技術已被接受的文獻和專 11/14 16:45
29F：→ Shilia: 利唸起。奠基在假 data 上是絕對不會有啥改變世界的突破的 11/14 16:47
30F：→ ggg12345: 感覺PCR反覆複製是為了定點切斷,供電泳後,量夠著色顯影 11/15 09:43
31F：→ ggg12345: 如果交大的蛋白質電晶體讓電泳排列的基因體因磁場順排而 11/15 09:50
32F：→ ggg12345: 觸發偵測出來,那是有可能不必如此多次費時反覆高量複製. 11/15 10:03
33F：→ jabari: 有夢最美 希望相隨 ......... 什麼時候可以超時空warp? 11/17 20:03